GI |
161032  |
Accession |
L03657 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Acoelomata ; Platyhelminthes ; Trematoda ; Digenea ; Strigeidida ; Schistosomatoidea ; Schistosomatidae ; Schistosoma ; Schistosoma bovis
|
Sequence |
TCACGGCGCACATTGAGTCGTGGATTGGGCGAGTGCTGCCGGCGTGTATACCCGCATATCAACGCGGGTTGCTGGTCAAAGGCTCCGTCCTAATAGTCGCCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATGACTTGATTGAGATGCTGCGGTGGGTTGTGCTCGAGTCGTGGCTTAATGACATTATACACGCTCGGGAAGAATCGCACCTATCGTACGCTACGTTGGTCACTTGATCTTGTCTCTATGGTTCGGTCTATGGTTTGTACCGATGGTGTGTGTAATACGCACGA |
Structure |
(((((((.((...)).)))))))...(((((.(.((((((((((.....((((((.(...)..)))))))))))))...)).)).)))))........(..(((((((((.((((.(((((.(((..((((((((((((((((((((((((.((((((.((((..(((((...)))).)))))))))))...).).).)))))))))).)).)..)......)))))))..)))))..))).)))).))).)).)))).)...(.(((((((...))))))).) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-68.2 kcal/mol |
Model |
226358265 |
Alignment |
Sbjct: ----GGCTTTTCATCTATCACGGCGCACATTGAGTCGTGGATTGGGCGAGTGCCTGCCGGCGTGTATACCCGCATATCAACGCGGGTTGCTGGTCGAAGGCTCCGTCCTAATAGTCCGGCCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATGACTTGATCGAGATGCTGCGGTGGGTTGTGCTCGAGTCGTGGCTTAATGACATTATACGCGCTCGGGAAGAATCGCACCTATCGTACGCTACGTTGGTCACTTGATCTTGTCTCTATGGTTCGGTCTACGGTTTGTACCGATGGTGTGTGTAATACGCACGAATTGTATAATTGA------------ ----.............(((((((.((...)).)))))))...(((((.(.(((((((((((.....((((((.(...)..)))))))))))))...))))).)))))........(((..(((((((((.((((.(((((.(((..((((((((((((((((((((((((.((((((.((((..(((((...)))).)))))))))))...).).).)))))))))).)).)..)......)))))))..)))))..))).)))).))).)).)))).))).(.(((((((...))))))).).............------------ Query: GGTCGGCTTTTCATCTATCACGGCGCACATTGAGTCGTGGATTGGGCGAGTG-CTGCCGGCGTGTATACCCGCATATCAACGCGGGTTGCTGGTCAAAGGCTCCGTCCTAATAGTC--GCCACAGCCTAGTCCGGTCTAGATGACTTGATTGAGATGCTGCGGTGGGTTGTGCTCGAGTCGTGGCTTAATGACATTATACACGCTCGGGAAGAATCGCACCTATCGTACGCTACGTTGGTCACTTGATCTTGTCTCTATGGTTCGGTCTATGGTTTGTACCGATGGTGTGTGTAATACGCACGAATTGTATAATTGACCCTGACCTCGG .................(((((((.((...)).)))))))...(((((.(.(-(((((((((.....((((((.(...)..)))))))))))))...)).)).)))))........--(..(((((((((.((((.(((((.(((..((((((((((((((((((((((((.((((((.((((..(((((...)))).)))))))))))...).).).)))))))))).)).)..)......)))))))..)))))..))).)))).))).)).)))).)...(.(((((((...))))))).)......................... CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________(______________________________(__________________)____________________________________________)___________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 95.833 III: 96.825 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 70
End: 395 |