GI |
15962  |
Accession |
X68137 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fagales ; Betulaceae ; Alnus ; Alnus viridis ; Alnus viridis subsp. crispa
|
Sequence |
GTTGCCCCCAACCCCATCGCCCTGCAAAGAGGCGGTTGGGGGCATGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGGGCTGATGCCTGCGGCTGGCCTAAAAACGAGTCCTCGGCCGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTGACAAACCCTCGTNNNNNNCGTGCGTGCATCGTCGCTCAATGTGTGCTCTTTTGACCCTGTCGCGTCGCTCGCGA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-53.5 kcal/mol |
Model |
199599960 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTCGCCCCCAACCCCATCGCCTCTCCAAGAGACGA-GGGCAGTTTGTGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGAGCTTCCACTTGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTAGG-CGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTGCCAAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCCTCGTTGCTCATCTTGTGCTC-TGTGACCCTGTAGTGTCGCGATTGCGACTCTTCCA .......(((((((((((.(((.(((.((((...)))).)))-)))....))).))))).)))...((((..(((((((......)))))))..)))).....(((((.....((-((((((((((((((((...(((.((((.....)))).)))......)))))).))).)))))))))...)))))....-..............(((((....)))))....... Query: NNNNATCGTTGCCCCCAACCCCATCGCCCTGCAAAGAGGCGGTTGGGGGCATGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGGGCTGATGCCTGCGGCTGGCCTAAAAACGAGTCCTCGGCCGACGAGCGCCACGACAATCGGTGGTTGAC-AAACCCTCGT-NNNNNNCGTGCGTGCATCGTCGCTCAATGTGTGCTCTTTTGACCCTGTCGCGTCGC--TCGCGANNNNN--- .......((((((((((..((..(((.(.(.....).).)))..)).....)).))))).)))...((((..(((((((......)))))))..)))).....(((.(.....((.((((((.(((((((.....(((.((((...-.)))).))).-......)))).)))..))))))))...).)))....................((((--..)))).....--- CBCs: _____________________________________________________________________________(________)_______________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________(_____________(_____(_____)_____)__________________)__________________________________________(___(_________(____________________________________________________________)______)___)________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80.952 II: 100 III: 86.667 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 211
End: 433 |