GI |
17719  |
Accession |
X68134 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fagales ; Betulaceae ; Betula ; Betula glandulosa
|
Sequence |
TTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTGTGTCGCGCTAGCGACGC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-73.6 kcal/mol |
Model |
199600006 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCAATGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGACAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCCGCGTTGCTCATCGTGTGCTCTTTGACCCTGCTGTGTCGCGCTAGCGACGCTTCCA------ ........(((((((..(((((.(((.(((....)).)).)))))).....)))))))).....((((..(((((.((....)).)))))..))))...(((.(((.(.((((((((((((((((((((.(((((.((((....)))).))).))...)))))).)))).))))))))....).).))))))).........(((((((....))))))).....------ Query: NNNNATCGTTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTG-CGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTGTGTCGCGCTAGCGACGCTTCCAACGCGA ........(((((((..(((((.(((.(((....)).)).)))))).....)))))))).....((((..(((((.((....)).)))))..))))...(((.(((.(.((((((((((.(((((((((.(((((.((((....)))).))).))...)))))).)))-.))))))))....).).))))))).........(((((((....)))))))........... CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________(____________(___________________________________________________________)_______________)________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.222 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 215
End: 445 |