GI |
8101490  |
Accession |
AF133786 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus from Acaulospora colossica spore IVB.7
|
Sequence |
TCAGCTCCTCTCTTGTTTCGACAGAAGAGGGGTTGGACTTGAGTGATCCCAACGGCAGTGATTTTCGAAGAACTGTTGGCGGGTCGCTTGAAATGCAGGTGCGGCAGGACACATCTTCTGAGCTATAAGCATTACTTATTTAGTCCCGTCAAACGGATTATATCTATTGCTGCAGCTAACATAAAGGTCGATTGTCCTTGTGCCCGACTGATGCAGGAAAATGAAGGCGGGTCTCTTGTAGACGCGTCCTTTGTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-85.8 kcal/mol |
Model |
316925997 |
Alignment |
Sbjct: ----AGTAAAACACCCTCAGCTCCTCTCTTGTTTCGACAGAAGAGGGGTTGGACTTGAGTGATCCCAACGGCAGTGATTTTCGAAGAACTGTTGGCGGGTCGCTTGAAATGCAGGTGCGGCAGGACACATCTTCTGAGCTATAAGCATTACTTATTTAGTCCCGTCAAACGGATTATATCTATTGCTGCAGCTAACATAAAGGTCGATTGTCCTTGTGCCCGACTGATGCAGGAAAATGAAGGCGGGTCTCTTGTAGACGCGTCCTTTGTTCAACTCGA------ ----............(((((((((((.((((....)))).)))))))))))..(((((((((((...(((((((..((....))..)))))))..)))))))))))..(((((((..(((((((((.(((.(((.((((...((((.((...((.((((((.((...)))))))).)).)).))))..)))).......)))..))))))))...))))..)))..))))....((((((((((.((((.....)))).)).))))))))........------ Query: TATCAGTAAAACACCCTCAGCTCCTCTCTTGTTTCGACAGAAGAGGGGTTGGACTTGAGTGATCCCAACGGCAGTGATTTTCGAAGAACTGTTGGCGGGTCGCTTGAAATGCAGGTGCGGCAGGACACATCTTCTGAGCTATAAGCATTACTTATTTAGTCCCGTCAAACGGATTATATCTATTGCTGCAGCTAACATAAAGGTCGATTGTCCTTGTGCCCGACTGATGCAGGAAAATGAAGGCGGGTCTCTTGTAGACGCGTCCTTTGTTCAACTCGATCTCAA ................(((((((((((.((((....)))).)))))))))))..(((((((((((...(((((((..((....))..)))))))..)))))))))))..(((((((..(((((((((.(((.(((.((((...((((.((...((.((((((.((...)))))))).)).)).))))..)))).......)))..))))))))...))))..)))..))))....((((((((((.((((.....)))).)).)))))))).............. CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 308
End: 592 |