GI |
8101481  |
Accession |
AF133777 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus from Acaulospora colossica spore IVB.5
|
Sequence |
TCACTACTATAACCTTTTTGTTATAATAGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCAATCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGCATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATATACAGAATTTTTGAGGTGACTTGTCTCCTC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-49.8 kcal/mol |
Model |
8101482 |
Alignment |
Sbjct: --------ATGAACACCTCACTACTATAACTTTTTTGTTGTAATAGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAATCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGCATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACCGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATATACAGAATTTTTGAGGTGACTTGTCTCCTCTTCAAATTTTGA--------- --------.........((((((.((((((......)))))).))))))..((((((.(.((((((....))))))).))))))...((((((((((((((((((....((((((..((((.(..((((...(..(((((((((....))))))))).)..)))))....)))))))))).)))))))...).))...)))))))).((((.((....)).))))............--------- Query: TCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACCTTTTTGTTATAATAGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCAATCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGCATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATATACAGAATTTTTGAGGTGACTTGTCTCCTCTTCAAATTTTGATCTGAAATC .................((((((.((((((......)))))).))))))..((((((.(.((((((....))))))).))))))...((((((((((((((((((....((((((..((((.(..((((...(..(((((((((....))))))))).)..)))))....)))))))))).)))))))...).))...)))))))).((((.((....)).))))..................... CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________(____________)_______________(_______________________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 308
End: 554 |