GI |
8101485  |
Accession |
AF133781 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus from Acaulospora colossica spore IVB.7
|
Sequence |
TCACAACTAACCTTTGGGTGAAATTGTGGAATTGGAATGCGCCGATTGTAATAATCAGCCCTTCTAAAATATATTTCATGACTGTCACCTAACACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGACATTGATTTGTCAAATCTTTGGCTNACATTTGCTTCAGGTTGTCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCATTCAAATTTTGA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-31.6 kcal/mol |
Model |
237626571 |
Alignment |
Sbjct: --------ATGAGCACTCTCACAACTAACCTTTGGGTGAAATTGTGGAATTGGAATGCGCTGATTTTAATGATCAGCCCTTCTAAAATATATTTCATGACTGTCACCTAACCACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGACATTGATTTGTCAAATCTTTGGCTTACATTTGCTTCAGGTTGTCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCATTCAAATTTTGA--------- --------..........((((((.((.((....))))...))))))..((((((.(.(((((((.....))))))).)))))))..(.(((((((.(((((.(((((....(.(((((((.((((.((.((.(((((((......))))))).)))))))).).).)))))).)))).).)))))).)).)))).)..........((((...))))--------- Query: TCAGTATCATGAGCACTCTCACAACTAACCTTTGGGTGAAATTGTGGAATTGGAATGCGCCGATTGTAATAATCAGCCCTTCTAAAATATATTTCATGACTGTCACCTAA-CACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGACATTGATTTGTCAAATCTTTGGCTNACATTTGCTTCAGGTTGTCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCATTCAAATTTTGATCTGAAATC ..................((((((.((.((....))))...))))))..((((((.(.((.((((.....)))).)).)))))))..(.(((((((.(((((.(((((..-.(.(((((((.((((.((.((.(((((((......))))))).)))))))).).).)))))).)))).).)))))).)).)))).)..........((((...))))......... CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________(_____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.857 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 345
End: 571 |