Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 853935

Figure

(Save as SVG or PNG)

Details

GI 853935 see NCBI Nucleotide
Accession X87356
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root cellular organisms Eukaryota Fungi/Metazoa group Fungi Dikarya Basidiomycota Agaricomycotina Agaricomycetes Agaricomycetes incertae sedis Polyporales Ganodermataceae Ganoderma Ganoderma lucidum 
Sequence TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCNNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGAC
Structure (((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
Method 3: Partial structure
Energy -58.5 kcal/mol
Model 210076557
Alignment
Sbjct: --ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCATTCTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGTGGATCGGCTCTCGGTGTGATAACATCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAATCGTCTCAGTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA
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Query: TCATGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGG-TTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCNNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGACCTCTG-
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 CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________(__________________)________________________________________________________________
HCBCs: __________________(__________________)______________________________________________________________________(___________________(___)___________________)___________________________(________)_______________
Transferred percentage of helices I: 100
II: 92.308
III: 100
IV: 100
Annotation Process: Blast (re)annotation
Start: 0
End: 203

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