| GI |
1279896  |
| Accession |
U52885 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Vuilleminiaceae ; Vuilleminia ; Vuilleminia pseudocystidiata
|
| Sequence |
TCAACCCACAAATTGTTTGTTCAGTCTGTGCGGCTTGGAATTGGAGGCATTGCTGGCGACGGTCGGCTCCTCTCAAATAAATTAGCTGGGCTTAGCTCGGTGGAACGGTCGGTGTGATAATTATCTGCGCCGTCACCTACTACACCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCGTATGCAATTCACCTTGA |
| Structure |
(((((((((..(........)......))).)).))))....(((((....((((((....)))))).)))))..........(((.((.....(((.((..(...(...((((((((....))).)))))....).)..).))..)..))).)))((((((.((......)).))).)....)) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-0.3 kcal/mol |
| Model |
75863795 |
| Alignment |
Sbjct: --------ATTAAATTCTCAACCCACTTGGATTTTATTATTCGATAGTGTGGATTGGATTTGGAGGTTTTTGCTGGC-AGAGTCAGCTCCTCTTGAAATGTATTAGCGAAGTTGCGCCCTTGTTCGTGTGGTCGGTGTGATAATTTATCAACACCTAACCCTAGAATA--GGGTTTCGCTTCTAATCGTCTTTGGACAATTTA---TGACCTTTTGA
--------.........(((((((((((((((......)))))..)))).)).)))).((.(((((.....((((((-...)))))).))))).))........((((((.....(((((.(((.(.(.(((.(((((((((...)))).)))))..))))).)).))--))))))))))((((((.(((....))).))).)---.))........
Query: TGAGCGTCGTGAATCTCTCAACCCAC--AAATTGTTTGTTCAGTCTGTGCGGCTTGGAATTGGAGG-CATTGCTGGCGACGGTCGGCTCCTCTC-AAATAAATTAGCTGGGCTTAG--CTCGGTGGAACGGTCGGTGTGATAA-TTATCTGCGCCGTCACCTACTACACCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCGTATGCAATTCACCTTGAATCT----
.................(((((((((--..(........)......))).)).))))....(((((-....((((((....)))))).))))).-.........(((.((.....(--((.((..(...(...(((((((((.-.)))).)))))....).)..).))..)..))).)))((((((.((......)).))).)....))....----
CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________((____________(_________________________________________)_________))_________________________________________
HCBCs: _________________________________________________________________________(__________)____________________________________(_____________(_(____________)_)_____________)_____________________(______)_____________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 66.667
II: 84.615
III: 75
IV: 88.889
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 59
End: 265
|
