GI |
1279888  |
Accession |
U52878 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Vuilleminiaceae ; Vuilleminia ; Vuilleminia comedens
|
Sequence |
TCAACCCACAAATTGTTTGTTCAGTCTGTGCGGCTTGGACTTGGAGGCATTGCTGGCGATGGTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGGCTTAGCTCGGTGGAACGGTTAGTGTGATAATTATCTGCGCTGCCTACTACATCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCGCAAGCAATTCACTTTGAA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-11.84 kcal/mol |
Model |
283854286 |
Alignment |
Sbjct: --------ATGAAATCATCAACCT-CATAGTTTTATTACTGT---TGRGGCTTGGATTTGGAAG--TTGCTGGCTATTAMGTCGGCTCTTCTTAAATGYATTAGCT--GCTTG--TCCGTGAGTTGGCTCAGAGTGTGATAAGTATCTACACTTGGTGGCTGCTTACATTGGATGTGGCTTCTAATCCGTCTTYGGACAACT--TTTAAGATCTGA --------.........((((((.-.(((((......)))))---...)).))))....(((((--..((((((......)))))).))))).....(.(((((..--(((.(--(((((((((.((((..(((((((((....))).))))))...))))))))))...))))..)))..))))).).((((..((.....--)).))))..... Query: TGAGCGTCGTGAATCTCTCAACCCACAAATTGTTTGTTCAGTCTGTGCGGCTTGGACTTGGAGGCATTGCTGGCGAT--GGTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGGCTTAGCTCGGTGGAACGGTT---AGTGTGATAATTATCTGCGCT-----GCCTACTACATCGGATCCCGCTTCTAAT-CGTCCGCAAGCAATTCACTTTGAATCT-- .................((((((...(..............)......)).))))....(((((....((((((...--.)))))).))))).....(.(((((....((..(..((.((((.(.(((.---((((((((....))).)))))-----)))).))))....)))...))..)))))-).(.((..((.......)).)).)...-- CBCs: ______________________________________________________________(_________________________)________________________________(_(_____________________________________)_)___________________________((___(_______)__))_______ HCBCs: ______________________________________________________________________(____________)____________________________(____________(_(______(_(___________)_)_______)_)____________)_____________________(_________)__________ |
Transferred percentage of helices |
I: 63.636 II: 100 III: 84.375 IV: 83.333 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 58
End: 261 |