GI |
1279891  |
Accession |
U52881 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Vuilleminiaceae ; Vuilleminia ; Vuilleminia coryli
|
Sequence |
CCCACAAATTGTTTGTTCAGTTTGTGCGGCTTGGACTTGGAGGTATTGCTGGCGATGGTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGGCTTAGCTCGGTGGAACGGTTAGTGTGATAATTATCTGCGCTGCCTACTACATCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCCAAGCAATTCACTTTG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-1.4 kcal/mol |
Model |
57869258 |
Alignment |
Sbjct: ----------------ATTAATATATCAAACCCT--CTCTTGTTGAGTGGTTTGGATGTGGGGGT-TTGTTGGCCTCGTAAAAGGGTTCAGCTCCTCTGAAATGCATTAGCAGAAC--AACCTGTT-----CATTGGTGTGATAACTATCTACGCTATTGAATGTGTGGGGCAGTTCAGCTTTCCAACGGTCCTTTGGACAAATATTTATCATTTATGTGA ----------------.....(((((((((((..--(((.....))).))))).))))))((((.-..((((((((..(...)))).))))).)))).(.(.((..(((((.((((--..((((((-----((.(((((((((....))).)))))).))))))...))....)))).)))....)))).).)...(((......)))............. Query: TGAGCGTCGTGAATCTCTCAACCCACAAATTGTTTGTTCAGTTTGTGCGGCTTGGACTTGGAGGTATTGCTGGC------GATGG--TCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTGGGCTTAGCTCGGTGGAACGGTTAGTGTGATAATTATCTGCGCTGCCTACTACATCGG---ATCCCGCTTCTAATCGTCCCAAGCAATTCACTTTGAATCT-------- .....................(.....((.(.....(.(.....).)..).))......)((((....(((((.------.....--))))).)))).....((...((((.(((.....(..(((.....((.(((((((((....))).)))))).))))).....).---.))).)))....).)).......(((......))).....-------- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________(__________(______((_________________________))_)_____________)____________________(__________)_____________ HCBCs: _____________________(________(_____(_________)__)_________)_(_______(____________________)____)__________________(___________________((___(___________)___))_________________)______________________(________)______________ |
Transferred percentage of helices |
I: 42.857 II: 69.231 III: 80 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 59
End: 261 |