GI |
1279894  |
Accession |
U52884 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Vuilleminiaceae ; Vuilleminia ; Vuilleminia cystidiata
|
Sequence |
TCTCAACCCACGAAGTTTTGTTCGCTTCGTGAGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGCGACGGTCAGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTGGGCTTTAGCTCGGAGGAACGGTCGGTGTGATAATTATCTGCGCCGTCACTTACTACTCCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCGCAAGCAATTCACTTTTGAAT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-14.2 kcal/mol |
Model |
254553126 |
Alignment |
Sbjct: --------ATTAAATTCTCAACTTCAATAGTTTGTAATGAACTTATTTGAAGCTTGGATGTGGAGG-CTTGCTGGCGTCTCAGATGTTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGT--GGATCCCGTTTGTTGGGTTACTTTGGTGTGATAATTATCTACACT-TTGGTTAGCTCAATGGGCTCTATGGGCATTTCTCAG-AACTTGTTCTGGTTTGGGTTTTGCATTAGTTTGCTTTACCTGGTTCATTAGAGTAGGGACTTTTCTGCTTTCAAACCGTCTGTGTATGCGGACAATTTTTGACTATTTGA --------.......(((.(.(((.(((((((((...))))).)))).).)).).)))...(((((-...(((((((((...)))).))))).)))))..........((.--((((.(((((((((((((((.(.(((((((((....))).)))))-..)).))))))))))).....))).).))))))...-.....((((.(...)))))........................................................................................... Query: TGAGCGTCGTGAATCTCTCAACCCACGAAGTTTTGTTCG---CTTCGTGAGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCTGGC------GACGGTCAGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTGGGCTTTAGCTCGGAGGAACG-GTCGGTGTGATAATTATCTGCGCCGTCACTTACTACTCCGGATCCCGCTTCTAATCGTCCGCAAGCAATTCACTTTTGAATCT----------------------------------------------------------------------------------------- ...............(((.(.(((.((((...(.....)---.)))).).)).).)))...(((((....((((((------...).))))).)))))..........(....((.(..(((((((((.(..(-(..((((((((....))).)))))....).)..).)))))).....)))...).)).).........((((......))))..----------------------------------------------------------------------------------------- CBCs: ______________________(__(((________________)))___)____________________________________________________________________(_(___((__(____(___________________________)____)__))________)_)___________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________(________________________)_______________________(________________)_______________________(______(__((_______(____(_(_(___________)_)_)______)_______))_______)_______)___________(((________)))___________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 75 II: 78.571 III: 77.419 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 59
End: 266 |