GI |
1279897  |
Accession |
U52887 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Punctulariaceae ; Punctulariopsis ; Punctulariopsis subglobispora
|
Sequence |
TCAACTCCGAGAGCATTTGTTTGCTCTCTGGGATTGGAATTGGAGGCTTGCTGGCGATGGTCAGCTCCTCTCAAATGAATTAGCTGGGCTGTGCTCGAGAGAAAACAGTCGGTGTGATAATTATCTGCGCCGTCGCCGAAGTATCTCGGATCCCGCTTCTAACCGTCCTCTGCAATACACCTTGAC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-4.26 kcal/mol |
Model |
205364292 |
Alignment |
Sbjct: --------ATTAATATATCAACCTCTTCAGCTTTTGCTTGTTGAGTG---TTGGATGTGGGGGTCTTTTTGCTGGTCTTCCCAGGTCAGCTCCCCTGAAATGCATTAGCGGAACAAT--TTGTGGACCGTTCATTGGTGTGATAACTATCTACGCTATTGACGTGAAGCA------GTTCAGCTTCTAACAGTCC------ATTCACTTGGACAAATTTTCATTAATGTGA --------.........((((((((..((((....))).)..))).)---))))...((((((.......((((((((....)))))))).))))))...((..(((((.((((..(--(((((......(((.(((((((((....))).)))))).)))))))))...------)))).)))...))))((((------(......))))).................. Query: TGAGTGTCATGAAGTTCTCAACTCCGAGAGCATTTGTTTGCTCTCTGGGATTGGAATTGGAGG----CTTGCTGGCGAT----GGTCAGCTCCTCTCAAATGAATTAGCTGGGCTGTGCTCGAGAGAAAACAGTCGGTGTGATAATTATCTGCGCCGTCGCC--GAAGTATCTCGGATCCCGCTTCTAACCGTCCTCTGCAATACACCTTGACATCT-------------- .................(((((......(((....)))........)...))))....(((((----...((((((...----.)))))).))))).....(..(((((.(((...(..((..(........(.(((((((((....))).)))))).)..)--)))..........))).)))...))).(((.......(......).)))....-------------- CBCs: ____________________________________________________________(________________________________)_________________(____________________(_(_____________________)_)___________________)____________________________________________________ HCBCs: _____________________________(______)______________________________________(________)___________________________(_______(______________(___(___________)___)________)____________)_____________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 66.667 II: 78.571 III: 79.31 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 59
End: 266 |