GI |
21968  |
Accession |
Z11762 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; Liliopsida ; commelinids ; Poales ; Poaceae ; BEP clade ; Pooideae ; Triticeae ; Aegilops ; Aegilops speltoides
|
Sequence |
ACGCCAAAACACGCTCCCAACCACCCTCATCGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGATCGGGCTGCCGGTGTACCGCGCCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTCGCTTTATCAACGCAGTGCATCCGACGCGCAGCCGACATTATGGCCTCAGAACGACCCAGCAAACGAAGCGCACGTCGCTTCGAC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-71.31 kcal/mol |
Model |
156254922 |
Alignment |
Sbjct: --------ACGCCAAAACACGCTCCCAACCCCCCTCATCGGGAATAGGGATGCGGCATATGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGGCCGAAGATCGGGCTGCCGGCGGACCGCGCCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTCGCTTTATCAACGCAGTGCATCCGACGCGTAGCCGGCGTGATGGCCTCAAAAGGACCCAGCAAACGAAGCGCACGTCGCTTCGACTGCGA --------(.(((.......((((((.(...(((.....)))..).)))).))))).).(((((.((((((((....))))))).))))))......(((((((((((..(.((((.(((((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)))).))))).)))))).....)))))..........(((....(((((((.....))))))).)))... Query: TGGGCGTCACGCCAAAACACGCTCCCAACCACCCTCATCGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGATCGGGCTGCCGGTGTACCGCGCCGGACACAGCGCATGGTGGGCGTCCTCGCTTTATCAACGCAGTGCATCCGACGCGCAGCCGACATTATGGCCTCAGAACGACCCAGCAAACGAAGCGCACGTCGCTTCGACC---- ........(.(((.......((((((.(...(((.....)))..).)))).))))).).(((((.((((((((....))))))).))))))......((((((.((((....((((.(((((((.(((..(((((((((....))).)))))).))).)))..)))).))))..)))).).....)))))............(....(((((((.....))))))).).---- CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________(________________________)___________________(__________________________________________________________________)__________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 94.286 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 373
End: 602 |