GI |
16001  |
Accession |
Z11758 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; Liliopsida ; commelinids ; Poales ; Poaceae ; BEP clade ; Pooideae ; Poeae ; Aveninae ; Avena ; Avena longiglumis
|
Sequence |
CGCTCCCAACCCCTTACGGGGGAACAGGATGCGGCATTTGGCTCCCCGTCACCCAAGGGCGGTGGGCCGAAGATATGGCTGCCGGCGCATCGTGTCGGACACAGCGCGTGGTGAGCGTCCTCGCTATACTTACCGCAGTGTCTCCGACACGTAGCCGGCGTGATGGCCTAGAATGACCCTTGTAACGGTGCGCATGACGCTCCG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-84.5 kcal/mol |
Model |
68510388 |
Alignment |
Sbjct: --------ACGCTAAACACGCTCCCAACCCCTTACGGGGGAACAGGATGCGGCATTTGGCTCCCCGTCACCCAAGGGCGGTGGGCCGAAGATATGGCTGCCGGCGCATCGTGTCGGACACAGCGCGTGGTGAGCGTCCTCGCTATACTTACCGCAGTGTCTCCGACACATAGCCGGCGTGATGGCCTAGAATGACCCTTGTAACGGTGCGCATGACGCTCCGACCGC --------..........((((((...(((((...)))))....))).)))...((((((((.(((((..(...)))))).)))))))).....((((((((((..((.(((((((((((.(((.((((((((((....)))).))).)))))).))))))..))))))).)))))).....)))).................(((.(((.....))).)))..... Query: TGGGCGTCACGCTAAACACGCTCCCAACCCCTTACGGGGGAACAGGATGCGGCATTTGGCTCCCCGTCACCCAAGGGCGGTGGGCCGAAGATATGGCTGCCGGCGCATCGTGTCGGACACAGCGCGTGGTGAGCGTCCTCGCTATACTTACCGCAGTGTCTCCGACACGTAGCCGGCGTGATGGCCTAGAATGACCCTTGTAACGGTGCGCATGACGCTCCGACC-- ..................((((((...(((((...)))))....))).)))...((((((((.(((((..(...)))))).)))))))).....((((((((((..((.(((((((((((.(((.((((((((((....)))).))).)))))).))))))..))))))).)))))).....)))).................(((.(((.....))).)))...-- CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________________________________________________________________________________________________(____________________________________________________________)__________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 370
End: 595 |