GI |
108947960  |
Accession |
DQ524231 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Genisteae ; Lupinus ; Lupinus guaraniticus
|
Sequence |
GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGCCCGCATGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACCGAGTCTGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGTTAAAGCTTGAGATCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGTGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTATTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-47.2 kcal/mol |
Model |
4321160 |
Alignment |
Sbjct: --------GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG --------((.((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))).. Query: TGGGTGTTGCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGCCCGCATGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACCGAGTCTGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCT--GTTAAAGCTTGAGATCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGTGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTATTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG ........((.((.((((((((((((((((.(.(.....).)))))))...).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((--((....))..).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.(((.((((...)).)..).)))..))))).. CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________________________________________________(_________________________(_____________________)_____________________________)____________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 95.238 IV: 92.308 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 387
End: 625 |