GI |
108948030  |
Accession |
DQ524301 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Genisteae ; Lupinus ; Lupinus sp. RJE 59
|
Sequence |
GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAATCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGAACCTCA |
Structure |
((.((.(((((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-72.3 kcal/mol |
Model |
4321160 |
Alignment |
Sbjct: --------GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG --------((.((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))).. Query: TGGGTGTTGCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAATCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGAACCTCAGG ........((.((.(((((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))).. CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________(_________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(___)___________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 628 |