| GI |
108947942  |
| Accession |
DQ524213 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Genisteae ; Lupinus ; Lupinus brevicaulis
|
| Sequence |
GCAGATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAGGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCCTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGAACCTCA |
| Structure |
((..(.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).).))...(((.(((.(...)))).)))..((((((.....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-65.6 kcal/mol |
| Model |
4321160 |
| Alignment |
Sbjct: --------GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG
--------((.((.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..)))))..
Query: TGGGTGTTGCAGATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAGGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCCTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGAACCTCAGG
........((..(.((((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))).)).).))...(((.(((.(...)))).)))..((((((.....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..)))))..
CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(___)___________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 95.652
II: 100
III: 97.619
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 628
|
