GI |
16025  |
Accession |
X68135 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fagales ; Betulaceae ; Alnus ; Alnus maritima
|
Sequence |
TTGCCCCCAACCCCATTGCCCTGCAAAGAGATGATGGGGGCATGTGGGGTAGACATTGGCCTCCCGTGGGCTTATGCTTGGGACTGGCCTAAAAATAATTCCTCGGCGACGATCGCCACGCCAACCGGTGGTTGAGAAACCCTCGTTATTGTTGTGCTTGCATCTTCAGTAATCGTGTGCTTCTTTTGACCCTGTCGTGTCTTGCTCGTGATGC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-30.5 kcal/mol |
Model |
17065650 |
Alignment |
Sbjct: ACGCATCGTTGCCCCCAACCCCATCGCCCTGCAAAGAGGCGGTGGGGGCATGCGGGGCGGACATTGGCCTCCCGTGGGCTGATGCCTGCGGCTGGCCTAAAAACGAGTCCTCGGCGACGATCGCCACGACAATCGGTGGTTGACAAACCTTCGTGACCCGTCGTGCGCGCATCGCCGCTCAACGCGTGC-TCTTTTGACCCTGTCGCGTCGCGCTCGCGACGCTTCCAACGCGA ........(((((((((.((((((((((((....)).))))))))))...)).))))))).....((((..((((((((....))))))))..))))...(((.((((..((((((.(((((((((((((..((((.((((....)))).))).)....)))))).))).)))).))))....).).))-)).))).........(((((((....)))))))........... Query: ---AANAGTTGCCCCCAACCCCATTGCCCTGCAAAGAGATGATGGGGGCATGTGGGGTAGACATTGGCCTCCCGTGGGCTTATGCTTGGGACTGGCCTAAAAATAATTCCTCGGCGACGATCGCCACGCCAACCGGTGGTTGAGAAACCCTCGTTA-TTGTTGTGCTTGCATCTTCAGTAATCGTGTGCTTCTTTTGACCCTGTCGTGTCTTGCTCGTGATGCTTCCAACATGA ---.....(((((((((.((((((((.(((....)).).))))))))...)).))))))).....((((...(.(((((....))))).)...))))...(((..(.(..(((..(..(((((.((((.(...(((.((((....)))).)))...-..).))))..)).)))..)..)....).).)..)..))).........(((((.(....).)))))........... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________((____________(((_____________)))_______________))_________________(________)____________________________________(____(_________________________________)_____)______________________________________((___(____)___))____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.238 II: 83.333 III: 76.471 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 215
End: 445 |