GI |
27753409  |
Accession |
AJ515387 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon sp. StBA26-1
|
Sequence |
TCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGAGACTTGGATTCGTCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-69.8 kcal/mol |
Model |
175851 |
Alignment |
Sbjct: ----AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTAGCTTCGAGAGGGCGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGAGACTTGGATTCGTCCGAGACTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCTGAAGCGCATGACTGAACG-TCCCGTGCCTCTAATGTGTCGACCGCTTATTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTTATTGACTTTTGA------ ----.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((.(.(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))..)))).)-)))))))))....)))))).((((.(((.((.((((....))))))).))))))..................------ Query: TGTCAGTAAATTCTCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGAGACTTGGATTCGTCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTAATTGACTTTTGACCTCAA .............((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((...(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))...))).).)))))))))....)))))).((((.(((..(.((((....))))).).))))))........................ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________(____________________)__________________________(__________________)_________________(_______________(_____________________(______________________________)____________________)______________)_____________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.368 IV: 92.308 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 396
End: 666 |