| GI |
63332857  |
| Accession |
AY971815 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon brunsii
|
| Sequence |
TCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGGAGACTTGGATTCGTCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGCGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTC |
| Structure |
((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((..(((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((...(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))...))).).)))))))))....)))))).((((.(((..(.((((....))))).).)))))) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-68.1 kcal/mol |
| Model |
175851 |
| Alignment |
Sbjct: ----AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTAGCTTCGAGAGGGCGCTTGGATAGTGGAGGTTGCC-GGAGACTTGGATTCGTCCGAGACTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCTGAAGCGCATGACTGAACG-TCCCGTGCCTCTAATGTGTCGACCGCTTATTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTTATTGACTTTTGA------
----.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((-.(((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((.(.(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))..)))).)-)))))))))....)))))).((((.(((.((.((((....))))))).))))))..................------
Query: TGTCAGTAAATTCTCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGGAGACTTGGATTCGTCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGCGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTAATTGACTTTTGACCTCAA
.............((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((..(((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((...(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))...))).).)))))))))....)))))).((((.(((..(.((((....))))).).))))))........................
CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ___________________(____________________)___________________________(__________________)_________________(_______________(_____________(_______(______________________________)_____)______________)______________)_____________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 97.368
IV: 92.308
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 397
End: 668
|
