GI |
63332882  |
Accession |
AY971840 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon brunsii
|
Sequence |
TCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGRAGACTTGGATTCATCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTC |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-65.7 kcal/mol |
Model |
175851 |
Alignment |
Sbjct: ----AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTAGCTTCGAGAGGGCGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGG-AGACTTGGATTCGTCCGAGACTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCTGAAGCGCATGACTGAACG-TCCCGTGCCTCTAATGTGTCGACCGCTTATTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTTATTGACTTTTGA------ ----.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(-((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((.(.(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))..)))).)-)))))))))....)))))).((((.(((.((.((((....))))))).))))))..................------ Query: TGTCAGTAAATTCTCAACCTCTCTCGATTGACTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGTTGCCGGRAGACTTGGATTCATCCGAGATTCGGGCTCTTCTGAAATGCATCGGCTTGCGGGCGACTTTCGACTATGTGCGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGCGCATGACAGAAGGTTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACCGCTTACTATCTCTCCGGAGAGAACAGGGTCTTCCTAATTGACTTTTGACCTCAA .............((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(.((.((((((....)))))).))).))).)))))...((((((.(((..((((..(((.(((...(((((((..(..(((...(((((..((...).))))))...))))..)))))))...))).).)))))))))....)))))).((((.(((..(.((((....))))).).))))))........................ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________(____________________)___________________________(__________________)_________________(_______________(_____________________(______________________________)____________________)______________)_____________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.368 IV: 92.308 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 396
End: 667 |