GI |
169618  |
Accession |
L08734 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia sorghi
|
Sequence |
TCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAATTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAG |
Structure |
((((((((..((((((....)))))..))))))))).....(((((..(((((((...))))))).)))))....(((.((((((.(((((((.(.(((((((((.(((((((((((..........(((((..(..(((((((((((...).))))))))).)..)))))..))))))))).).)).)))))))))))))).)))))))..)).))).....(((((...))))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-25.7 kcal/mol |
Model |
154002627 |
Alignment |
Sbjct: ----ATGAAACCCTCTCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAATTTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAGA------ ----...........((((((((..((((((....)))))..))))))))).....(((((..(((((((...))))))).)))))....(((.((((((.(((((((.(.(((((((((.(((((((((((..........(((((..(..((((((((((((...).))))))))).)).)))))..))))))))).).)).)))))))))))))).)))))))..)).))).....(((((...))))).------ Query: TGTCATGAAACCCTCTCACAAAATAAATAATTTTTATTATGATTTTTGTGGATGTTGAGTGCTGCTGTGTTACACATAGCTCACTTTAAATGTATAAGTCATCTTCTTTATATAGCAAAAAAGAAGAGATGGATTGACTTGATGTGTAATAA-TTTTTTTTCATCACATTGAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTTATATTATTTTGTTGTTGAGATAGAGACTACTAAACAAACAATTTAAAATTTAAGACCTCAA ...............((((((((..((((((....)))))..))))))))).....(((((..(((((((...))))))).)))))....(((.((((((.(((((((.(.(((((((((.(((((((((((..........(((((..(..-(((((((((((...).))))))))).)..)))))..))))))))).).)).)))))))))))))).)))))))..)).))).....(((((...)))))....... CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 98.182 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 195
End: 452 |