GI |
169599  |
Accession |
L08702 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia recondita
|
Sequence |
ACCCTCTCATTAAACAATTTTGTAAAAAGAAATTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTGAATGGAGACTTCTAAAAAAACCCCCCTTAACCATTTTAAG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-5.51 kcal/mol |
Model |
110903728 |
Alignment |
Sbjct: ----ATGAAACCCTCTCATTAAACAATTCCTT--TAAGGAACTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATGAGTTGGATTGACTTGATGTAATAATTTTTTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTGAATGGGGACTTCTAAAAAA--CCCCTTTA-----TTTAAGA------ ----.....(.(.((.(((((((((.(((((.--..))))).))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.((((((.((((((.(((.......((.(((..(.(....((((..(.(.......).)))))).)..))).).)))).))))))))).)))))))).)))....--....(((.-----...))).------ Query: TGTCATGAAACCCTCTCATTAAACAATTTTGTAAAAAGAAATTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAA----TTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTGAATGGAGACTTCTAAAAAAACCCCCCTTAACCATTTTAAGACCTCAA .........(.(.((.(((((((((.((((.......)))).))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((..(((((.((((((.(((.......((.(((..(.(----((((..(.(.......).)))))).)..))).).)))).))))))))).)).))))).)))..........(((.........)))....... CBCs: ____________________________(_________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________(_______)_________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(_____________)_______ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.444 II: 100 III: 97.222 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 193
End: 417 |