GI |
169600  |
Accession |
L08703 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia graminis ; Puccinia graminis f. sp. secalis
|
Sequence |
ACCCTCTCATTAAACATTTTTTTAATAATTTGTTTATTGGATGTTGAGTGTTGCTATAATTATAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGTAAAACACTTGCCATCTTTTTTGTAACAAGAGACTCCTAAAACCCAATATCTATTTTTTTTAAGA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-3.81 kcal/mol |
Model |
62484160 |
Alignment |
Sbjct: ----ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTTTTTTTAATAATTTGTTTATTGGATGTTGAGTGTTGCTATAATTATAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGTAAAACACTTGCCATCTTTTTTGTAACAAGAGACTCCTAAAAACCCAATATCTA-TTTTTTTAAGA------ ----.....(.(.((.((.((((((......((.....))..)))))).)))).).)(((((..(((((....))))).))))).......(..((((..((((((((.(((.(((.......((((((.((.(((((..(.(.......).)))))).))...))))).)))).))).)))).)..))).))))..)............(((.-(......))))------ Query: TGTCATGAAACCCTCTCATTAAACA---TTTTTTTAATAATTTGTTTATTGGATGTTGAGTGTTGCTATAATTATAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGTAAAACACTTGCCATCTTTTTTGTAACAAGAGACTCCT-AAAACCCAATATCTATTTTTTTTAAGACCTCAA .........(.(.((.((.((((((---...((.....))..)))))).)))).).)(((((..(((((....))))).))))).......(..((((..((((((((.(((.(((.......((((((.((.(((((..(.(.......).)))))).))...))))).)))).))).)))).)..))).))))..)-...........(((..(......))))...... CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 192
End: 419 |