Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 169619

Figure

(Save as SVG or PNG)

Details

GI 169619 see NCBI Nucleotide
Accession L08735
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Pucciniomycotina ; Pucciniomycetes ; Pucciniales ; Pucciniaceae ; Puccinia ; Puccinia striiformis 
Sequence ACCCTCTCATTAAATAATTTTGATTAATTATTTTCAATGGATGTTGAGTGCTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCTATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGATTGTAGCAATACTGCCATCTTATTTAAGGGAGACTCCTAAAAACCCAATTTTAACCTTAAGA
Structure (.(.((.((((.((.((...(((....))))))).)))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((..((((.(((((..(((((.(((.......((((((..(.((...(((.(.......).))).)).)..))))))))).)))))..))))).))))..)))..........((.(...)..))
Method 3: Partial structure
Energy -0.91 kcal/mol
Model 158605137
Alignment 
Sbjct: ----ATGAAACCCTCTCATTAAATAATTTTGATTAATTATTTTCAATGGATGTTGAGTGCTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCTATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGATTGTAGCAATACTGCCATCTTATTTAAGGGAGACTCCTAAAAACCCAATTTTAACCTTAAGA------
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Query: TGTCATGAAACCCTCTCATTAAATAATTTTGATTAATTATTTTCAATGGATGTTGAGTGCTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCTATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGATTGTAGCAATACTGCCATCTTATTTAAGGGAGACTCCTAAAAACCCAATTTTAACCTTAAGACCTCAA
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 CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Transferred percentage of helices I: 100
II: 100
III: 100
IV: 100
Annotation Process: Blast (re)annotation
Start: 191
End: 406

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