GI |
300068267  |
Accession |
AB557592 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Sophoreae ; Sophora ; Sophora flavescens
|
Sequence |
GCACATCGTTGCCCCAATGCCTCAGCCCTGTTGCTAGGCATAGTAAAGGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCGATGCCTCGCGGTTGGCTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGTGCGCCGCGATGGATGGTGGTTGAGTAAGAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCTACCGGATTTGTGACTCTTTGACCCATGAGCGGCCGTTGGCTGCCCACGACGGGACCTCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-47.8 kcal/mol |
Model |
4321160 |
Alignment |
Sbjct: ----GCACATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACG-TGCTAGGCACCA-AGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGAACCTCAGG ----((.((.((((((((((((((((.(((....-.)))))))))..-.).))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..(((((((....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))))))))))..(((((.((((((((...)).)..)))))..))))).. Query: TGTCGCACATCGTTGCCCCAATGCCTCAGCCCTGTTGCTAGGCATAGTAAAGGGGTGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCGATGCCTCGCGGTTGGCTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGTGCGCCGCGATGGATGGTGGTTGAGTAAGAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCTACCGGATTTGTGACTCTTTGACCCATGAGCGGCCGTTGGCTGCCCACGACGGG-ACCTCAG- ....((.((.(((((((((.((((((.(((......)))))))))......))))))).)).))))...(((.(((.(...)))).)))..((.((((....((((((.((((((.(.(.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..).)))))).)....).))))))))).))..((((...(((((((...)).)..)))).-..)))).- CBCs: ____________________(_______________________)________________________________(___)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____________(__________)________________)_____________________________________________________(___(_________((____________(_______________)_________))__________)____)______________________(_____(________________)______)____ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 92.857 IV: 84.615 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 436
End: 671 |