GI |
146424368  |
Accession |
AM262454 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Crotalarieae ; Crotalaria ; Crotalaria lebeckioides
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Sequence |
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTGGGCCTCGTGCTAGGCACCGAGCTGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGTCGTGACGGATGGTGGTTGAGTAAAAGAAAGCTCGAGACCCATCGTTGGTGTCACCCTCACCGGCATTGCGACTCTATGATCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-56.5 kcal/mol |
Model |
11120115 |
Alignment |
Sbjct: ----GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAGCTGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGTCGTGACGGATGGTGGTTGAGTAAAAGAAAGCTCGAGACCCATCGTTGGTGTCACCCGCACCGGCATTGCGACTCTATGATCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA------ ----(((.((.(((((((.(((((((.(((.....))))))))).....))))))).))).)))...(((.((((...).))).))).(((.....((.((((((.((((((..(((((..((((((((((((((((((((........))))))...))))))))..)))))).))).))..))))))))))).))..))))....(((((.(.((...)).))))))...------ Query: TGTCGCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTGGGCCTCGTGCTAGGCACCGAGCTGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGTCGTGACGGATGGTGGTTGAGTAAAAGAAAGCTCGAGACCCATCGTTGGTGTCACCCTCACCGGCATTGCGACTCTATGATCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGACCTCAG ....(((.((.(((((((.(((((((.(((.....))))))))).....))))))).))).)))...(((.((((...).))).))).(((.....((.((((((.((((((..(((.(..((((((((((((((((((((........))))))...))))))))..)))))).).).))..))))))))))).))..))))....(((((.(.((...)).))))))......... CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.619 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 412
End: 649 |