| GI |
146424360  |
| Accession |
AM262446 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Crotalarieae ; Lotononis ; Lotononis alpina
|
| Sequence |
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAATGGGGCGAATGCTGGCTTCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAAGTCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAATAAAACTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGATTTGCGACTCTATGGCCCATGGGCGTCTTTTGGTCCC |
| Structure |
((((.(((.((((..(((((....(...)))))).)))).)))...)))).(.(..(((((.(((.((((...).))).)))..)))))...).)((.((.((((.((..(.(((.(((.(((.((((..((((.......)))).)))).))))))))).)..)))))).)).)).(.((((..(.(((.(....).).)).).)))).) |
| Method |
3: Partial structure |
| Energy |
-33.2 kcal/mol |
| Model |
157673689 |
| Alignment |
Sbjct: ----GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGATCGGGGCGAGTGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGGTCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCCGTTGGTCGCCCAAGAC
----((((((((.((((..(((((....(...)))))).)))).))))..)))).(((..(((((..((((((((...).)))))))..)))))...)))(((((.((((.((.((((((.(((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))))))).))))))).))))).((((((..(((((.(....).).)))).)))))).......
Query: TGTCGCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAATGGGGCGAATGCTGGCTT-CCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAAGTCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAATAAAA-CTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGATTTGCGACTCTATGGCCCATGGGCGTCTTTTGGTCCCC------
....((((.(((.((((..(((((....(...)))))).)))).)))...)))).(.(..(((((.-(((.((((...).))).)))..)))))...).)((.((.((((.((..(.(((.(((.(((.((((..((((......-.)))).)))).))))))))).)..)))))).)).)).(.((((..(.(((.(....).).)).).)))).).------
CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: ______________________(___________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(_____________)________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 94.444
II: 87.5
III: 84.848
IV: 83.333
|
| Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 392
End: 608
|
