GI |
226349021  |
Accession |
FJ820644 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
TCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTTGCTGGCCCATTAATGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-66.2 kcal/mol |
Model |
116687750 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATCATCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTTGCTGGCCCATTACTGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGATCATTTC------ ----.........((((((((((((((((((....))))))))))).))).))))....(((((....(((((((((....))))))..))).))))).((.((....((((((.((...(((((.(((....((((((((.(((...)))..)))))))).)))))))).))..))))))..)).))....(((((((...))))))).......------ Query: TGTCGCGAAATCATCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTTGCTGGCCCATTAATGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGATCATTTCGACCTC .............((((((((((((((((((....))))))))))).))).))))....(((((....(((((((((....))))))..))).))))).((.((....((((((.((...(((((.(((....((((((((.(((...)))..)))))))).)))))))).))..))))))..)).))....(((((((...)))))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 433
End: 654 |