GI |
92110578  |
Accession |
DQ340310 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Corticiaceae ; Hyphodontia ; Hyphodontia nespori
|
Sequence |
TCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTTTGCTGGCCCATTACTGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGA |
Structure |
((((((((((((((((((....))))))))))).))).))))....(((((....(((((((((....))))))..))).))))).((.((....((((((.((...(((((.(((....((((((((.(((...)))..)))))))).)))))))).))..))))))..)).))....(((((((...))))))) |
Method |
3: Partial structure |
Energy |
-66.9 kcal/mol |
Model |
116687750 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATCATCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTTGCTGGCCCATTACTGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGATCATTTC------ ----.........((((((((((((((((((....))))))))))).))).))))....(((((....(((((((((....))))))..))).))))).((.((....((((((.((...(((((.(((....((((((((.(((...)))..)))))))).)))))))).))..))))))..)).))....(((((((...))))))).......------ Query: TGTCGCGAAATCATCAACTCCTCTCTTTTGCTTTTGTAAAGGAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTTTGCTGGCCCATTACTGGGTTCTGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGATCTCTATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCTTCACTGCATCGCTCGAGTTGAAGCTAGCTTCTAATCGTCCTTAGGGACAATCTCTGATCATTTCGACCTC .............((((((((((((((((((....))))))))))).))).))))....(((((....(((((((((....))))))..))).))))).((.((....((((((.((...(((((.(((....((((((((.(((...)))..)))))))).)))))))).))..))))))..)).))....(((((((...)))))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 393
End: 614 |