GI |
87244876  |
Accession |
DQ377374 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Cantharellaceae ; environmental samples ; uncultured Cantharellaceae
|
Sequence |
TCAAGCCGTGGATGCTTTTCGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTATTTGGRCTTTGCCGTATCCTTTTGGAGATGGCTGGTCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCGTTTGGATTGCTCTCTAATCTGGTTGATGGATTG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-19.8 kcal/mol |
Model |
225007808 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTCTCAAGCGGTGGATGCTTTTTGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTA-TTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGGGAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCATTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGTTTATGGGTTGCTA-ATAACAATCTGTTCCATTTTTCAACTTGA ----.........((((((.(.((((((((.(...))))))))).).))))))...-..((.(...(((((.((((...)))).))))).).)).....((.(..(((.(((((..((((.((...(((((((((((((((.(.((......)).))))))))....).....))...)))).))).))))..)))))))).)))....((((.(...)))))...-............................. Query: TGTCGCGAAATTCTCAAGCCGTGGATGCTTTTCGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTATTTGGRCTTTGCCGTATCCTTTTGGAG-ATGGCTGGTCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCGTTTGGATTGCTCTCTAATCTGGTTGATGGATTGCTATATAACAATCCGTTCCAATTTTCA------ .............((((((.(.((((((((.(...))))))))).).))))))......((.(...(((((.(.((...)).)-))))).).)).....((.(..(((.(((((..((((.((...(((((((((((((((.(.((......)).))))))))....).....))...)))).))).))))..)))))))).)))....((((......))))...........................------ CBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________________________________________________________________(_______________)_________________________(____((_______________________________________________________________________))____)________________(______)____________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 91.667 III: 100 IV: 80 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 360
End: 609 |