GI |
111608682  |
Accession |
DQ822796 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; environmental samples ; uncultured Cantharellales
|
Sequence |
TCAAGCCGTGGATGCTTTTTGTTAAGTGTTCTAAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGTATTAGCTGATCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGTTTATGGGTTG |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-23.5 kcal/mol |
Model |
225007808 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTCTCAAGCGGTGGATGCTTTTTGTAAAGTGTTCTCAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGGGAACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCATTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGTTTATGGGTTGCTAATAACAATCTGTTCCATTTTTCAACTTGA ----.........((((((.(.((((((((.(...))))))))).).)))))).....((.(...(((((.((((...)))).))))).).)).....((.(..(((.(((((..((((.((...(((((((((((((((.(.((......)).))))))))....).....))...)))).))).))))..)))))))).)))....((((.(...)))))................................ Query: TGTCGCGAAATTCTCAAGCCGTGGATGCTTTTTGTTAAGTGTTCTAAGCTTGGTTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTTGGG--ATGGCTGGCCTTAAAAGTATTAGCTGATCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTAACTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGGTGGCCAATTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGTTTATGGGTTGCTAATAACAATCCGTTCCATTTTTCAATT--- .............((((((...((((((((......))))))))...)))))).....((.(...(((((..(((...)))--))))).).)).....((.(..(((.(((((..((((.((...(((((((((((((((.(.((......)).))))))))....).....))...)))).))).))))..)))))))).)))....((((.(...))))).............................--- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ___________________________________________________________(________(_______________)______)_______________________((_______________________________________________________________________))________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 91.667 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 388
End: 636 |