GI |
194045541  |
Accession |
EU816621 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulinaceae
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTRCGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATKGTACAATCTGTGTTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-38.4 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCACA-TTCAGCTTGACCTCGA ----(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..-................ Query: TGTCGCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTRCGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATKGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGC---------- ....(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((..((((((((..(...)))..))))))..))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((........))))))..))).........---------- CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 95 III: 100 IV: 90 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 377
End: 624 |