GI |
190682974  |
Accession |
EU645631 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; environmental samples ; uncultured Clavulina
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-19.9 kcal/mol |
Model |
215433632 |
Alignment |
Sbjct: ----GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCAC-ATTCAGC-TTGACCTCGA ----(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).-.......-.......... Query: TGTCGCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCTGT-CCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGACCTCGA ....(((((..((((((((.((((((((...(...).))))-.).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..))).................... CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________(___________)______________________________________((___________(_____________)____________))_____________________________(__________________________________)______________________________((________________))_________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 95.652 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 353
End: 610 |