GI |
313761509  |
Accession |
HQ445013 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus
|
Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGGATGATGACAATCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGAACTGGTTCCACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCCTTCGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGATTGCTTCTAGACCTGGCTTTGCAGATTGTGTTTGATCTGTATTCCA |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-0.3 kcal/mol |
Model |
225007805 |
Alignment |
Sbjct: ----GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTCTGTCCTTAGTTTGGTTGTTGAGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGAACGGCTGGCCCTAAAAGCATTAGCTGATCCATGTGTGGGACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCGGTTTTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTATGCAGATTGT-TTGAATCTGTATTCCGCTTTTCAGCTTTGA ----(((((..((((((((.(((((((((....))))).).)))))))).....))).))))).((.((...((((((.(((((((((..(...)))..)))))).)))).))).)).)).(((...((((((.((((..(.((.(((.(((((.((((....)))).)).))).)))))))))))))))).)))........(((..(((((((.(.(-...))))))))).))).............. Query: TGTCGCGAAATTTCTCAAGCTTGGGATGA--TGACAATCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGAACTGGTTCCACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCCTTCGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGATTGCTTCTAGACCTGGCTTTGCAGATTGTGTTTGATCTGTATTCCAACTTTCAGCTTTG- ....(((((..((((((((.(((((.((.--...)).).).)))))))).....))).))))).((.((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).)).)).(((...(.((((.(((......(.(((.(((((..((......))..)).))).))))...))))))).).)))........(((...((((((.(.(....))))))))..))).............- CBCs: __________________________(________)______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____(______(___________(____________)_________________)_____)____________________________________________________________________________________(_____(________________)______)__________________________(______________(____)___________)______________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90.909 II: 95 III: 78.571 IV: 91.667 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 375
End: 622 |