GI |
162423800  |
Accession |
EU149820 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Fungiina ; Fungiidae ; Cycloseris ; Cycloseris costulata
|
Sequence |
GCACCAAGTGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGCCCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGAGCGAGTCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACTTTTCAACTCTT |
Structure |
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Method |
3: Partial structure |
Energy |
-14.7 kcal/mol |
Model |
52547259 |
Alignment |
Sbjct: ----GGATATCATCCAACGCACTTTGCGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTCGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTCAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGTTCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAATGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGATGCGGCCCGCCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACATTTAAACTCTTGA------ ----..............((((.(...))))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(...(((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).)..).)))))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))..------ Query: TGTCGGACATCATCCAACGCACCAAGTGGTGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCCTTCTTGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGTTAGAGAGACTCGCCGCGGCACGGGCCCGTTCCCTGCACACTCGCGGAGGCTAAAAACGCTTTTGCCCTTCGCGTGCACGGGA-GCGAGTCGTCCGCCGAGTCGCGGAGGCGAACACTTTTCAACTCTTGACCTCAG ..................((((......)))).(.(((((((.(.((((((..((...).)))))))).))))))...)).....((((((.((((......(....((.(((((((....((((((((.((((....))))).)))))))))))..).).-).)).))))..).))))))...((((.(((.....))...)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________(_____________________________________________)_____________(________(____(_________________________________________________________)_)__)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 80 II: 100 III: 96.97 IV: 100 |
Annotation |
Process: Blast (re)annotation
Start: 387
End: 600 |