Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (163 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Clavulinaceae: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Cantharellales; Clavulinaceae;
Select All
>171188489 see NCBI Nucleotide Clavulina sp. OSC 1064248 Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACTTCAGAAAGGTTATTGCCTTATTTGAATTGGATGTTGGAGGGCTTGCTGATGTTGTTGTCAGCTCCTCTTAAATGCATTAGCGGAATTTTAAGGACCGGCTTTGGTTTGATAATCCTATCTATGCCATTGCTGTGGATCTTTGTGTGTTCAGCTTCTAATGGTCTTTTGGACTGTCTCATTGGGTGAGGCATATATAGTGTCTTGA
.........((((.((((((((((.(...))))).))))))))))...(.((((((...(((((((...).)))))))))))).).....(..((((((..(((((((.(((((..((((.(((((....))).)).))))..))..))).))).)).).)))).)))..)....((((...))))..................................
>114414789 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTATCTCGGTTTGGTTATTGGGCTCTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAGGCATTAGCTGACCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAATTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGATTATGGGTTGCCAACCAGCAATCTATTCCATTTTCAACTTTGA
.........(((((((((((((......)))))).))))))).....((.(...(((((..(((.....)))))))).).))...........((.((.((.((.((((.((.(((((..........(((((....))).)..)))))).).)))....)).)).)).)).)).......(((......)))...................................................
>186908955 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAGCTAGATGCTTTTTTGTATCTCGGTTTGGTTATTGGGCTCTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAGGCATTAGCTGACCCTCATGATGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGACCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAATTCTCGTTTGGGTTGCTCTCTAATCTGGATTATGGGTTGCCAACCAGCAATCTATTCCATTTTCAACTTTGA
.........(((((((((((((......)))))).))))))).....((.(...(((((..(((.....)))))))).).))...........((.((.((.((.((((.((.(((((..........(((((....))).)..)))))).).)))....)).)).)).)).)).......(((......)))...................................................
>116876118 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGGCTTTGTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTACAGATTCTTCAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.(((((.(((...)))))))).....))).)))).((.(..((.(...(((((.(((.......)))))))).).))).)).......(.(......(((.(.(..(.((.((....((((((((((....))).)..)))))))).)))).).)))).)............((((((.....)))))).............................................
>111608684 see NCBI Nucleotide Clavulina sp. KGP89 Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTATGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAATGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTGTTGCAAGTTATTTCAATCTGTAATGCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.((..((((.....)...))))).))).)))).....((.(...(((((.((...(...)))))))).).))............((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..).)..))).))))........(((((..(...))))))..............................................
>148612679 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGCCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((..(((((((.....))).))))..))).)))).....((.(...((..((((((.....)))))))).).))...........(((((....((((.((..(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))....)))..))).)))))(((....)))..........................................................
>156634987 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
ACGAAATTTCTCAAGCTAGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCGCGGATTGTTCAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........((((((((((((((.(....).))))))).))).)))).....((.(...(((((.((.......)).))))).).))...........(((.(((((((((.(..((..((.(.(.(((((((((((....))).)..))))))).).).))..))).)))).............))))))))..(((...((((((...)))))))).)..........................
>189306935 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGNATTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGCACGGNTGGNCTTAAAAGCATTANCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGANGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATTTGNGTTCCACATNTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.((((((((.(.(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.((((((((..((...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............
>111608685 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAACCGGGATGCTTTTTTTGTTTCTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGGTGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTTCTAATTTTGGTAGAGCAGATTCTGAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTTGA
.........((((.((((((.((.......)).)))))).))))....((.(...((.((..(((.....))))).)).).))...........((.(((((.((..((((.(.(((((..........(((((....))).)..)))))).).))).....).)).))))).)).......(((.....)))................................................
>157057268 see NCBI Nucleotide Clavulina cinerea Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGGACGGCTGGCCTTATAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.(((.(((((((((..(....)))..)))))).)))).))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............
>157086827 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>157086829 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>157086828 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCCGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCGTTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>148612667 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAACCGGGATGCTTTTTTGTTTCTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGATGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTCCTAATTTTGGTCGAACGGATTCTGAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTTGA
((((((.((((((.((((((.(...(...).))))))).)))).....)).)))))).((.((...(((.((.(((((((((.(...).))..))))))..)))..)).))).)).(((...((((((.((((....(((.((.((((((.(((....))))).).))).))))).))))))))).))))........(((...((((((.(....))))))))))...............
>166850560 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAACCGGGATGCTTTTTTGTTTCTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGATGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTCCTAATTTTGGTCGAACGGATTCTGAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTTGA
((((((.((((((.((((((.(...(...).))))))).)))).....)).)))))).((.((...(((.((.(((((((((.(...).))..))))))..)))..)).))).)).(((...((((((.((((....(((.((.((((((.(((....))))).).))).))))).))))))))).))))........(((...((((((.(....))))))))))...............
>104304700 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 2 (see details)
GTGAAGTTCTCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGATTCTTGAATCCTGCTCCATTTTTCAATTTTGA
.........((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))...............................
>104304701 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 3 (see details)
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATCTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT
((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))
>104304708 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 3 (see details)
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT
((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))
>104304706 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 3 (see details)
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCGGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGATCTTG
(((((.(..(((..(....)..)).)...).).........))))....((.(...(((((.((........)).))))).).))...........(((..(((((.((((.(..((..((.(.(.(((((((((((....))).)..))))))).).).))..))).)))).............))))))))...((....(((((...))))).))
>104304704 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 3 (see details)
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGCGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTATTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT
((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((...(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))
>104304703 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulinaceae Method 3 (see details)
TCAAGCTAGGTGCTTTTTTGCTTGACAAAAATGTGGTTAGCTTGGTATTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGAACGGCTGGTCTTAAAGACATTAGCTTGACCCTTCACGTGGTATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTAACCGCTGAGGACATCTTTTGGGGTGGCCAATTCTTGTTGGGGTTGCTTTCTAATCTGGTTTGCAAGAT
((((((((((((.((.(.((.....))))).)))..)))))))))....((((...((((..(.((......)).))))).).)))..........(((..(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((....))).).).))))))....).....))...)))))))))).)).)))))))))..........(.((....)))
>189306934 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 3 (see details)
GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGTGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCA
(((((..(((((.(((.((((((((.....(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((..((((.((.((((((((..((...)))..)))))).)))..))))))))).(((...((((((.((((...(.(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))
>147742855 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 3 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGNCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCA
(((((..((((((((.((((((((..(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((.(...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).).))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))
>115605487 see NCBI Nucleotide Clavulina cf. cristata src75 Method 3 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGNCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCA
(((((..((((((((.((((((((..(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((.(...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).).))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))
>115605489 see NCBI Nucleotide Clavulina cf. rugosa src661 Method 3 (see details)
CGAAAATTCCTCAAGCTTTGGATGGCTTTTTTGTCTGTCCTTGGGCTTGGTTGTTGGGCTCTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCCGATCCTCGTGTGGTACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTCTGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCGGTTTCGCAGATTGCTCNATCTGTGTGCC
((..(..((((((((.(((((((((...(...).))))).).)))))))).....))).).))..(((((...(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))))).))).))))..)))))))))).)))........((..(((((((.(.....))))))).)))
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.