Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (93 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Colletotrichum truncatum: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; sordariomyceta; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreomycetidae incertae sedis; Glomerellaceae; mitosporic Glomerellaceae; Colletotrichum; Colletotrichum truncatum;
Select All
>223016911 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGT
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))((((((.......))))))......
>226511133 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATTGGGATTCGAAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTTAATGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....))))))))).....(((..((((((.((((.(((((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.......))))).
>226511134 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATTGGGATTCGAAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTTAATGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....))))))))).....(((..((((((.((((.(((((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.......))))).
>239923249 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>239923256 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>239923257 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>239923260 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>239923261 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>166797309 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTCTAATG
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((.(((.....)).)..))))..)))))))))))))..))).))).(((((.........))).))...
>76886582 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCC
(((((....)))))...((((.(((...))).))))..(((((((..(((...(((((((((....))))))))))))..)))))))..(.(...(((((..((((((...)))))).))))).).)
>76886583 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCAGCTTGGTGTTGGGGCC
(((((....)))))...((((.(((...))).))))..(((((((..(((...(((((((((....))))))))))))..)))))))..(.(...(((((..((((((...)))))).))))).).)
>76886584 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCAGCTTGGTGTTGGGGCC
(((((....)))))...((((.(((...))).))))..(((((((..(((...(((((((((....))))))))))))..)))))))..(.(...(((((..((((((...)))))).))))).).)
>227437234 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGSACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCC
(((((....)))))...((((.(((...))).))))..(((((((..(((...(((((((((....))))))))))))..)))))))..(.(...(((((..((((((...)))))).))))).).)
>182341636 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCT
(((((....)))))...((((.(((...))).))))..(((((((..(((...(((((((((....))))))))))))..)))))))..(.(...(((((..((((((...)))))).))))).).)
>263043759 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>263043761 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>263043763 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>124110173 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>162285903 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTAACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGATTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTTTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))..))).))))....)))..((((((....)))))).
>214011048 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>214011049 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTT
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))..........((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))...((((..............))))
>214011050 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>214011051 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>214011052 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
>214011053 see NCBI Nucleotide Colletotrichum truncatum Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((((((...))))))).
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.