Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (177 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Ganoderma lucidum: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Polyporales; Ganodermataceae; Ganoderma; Ganoderma lucidum;
Select All
>90109964 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTTGTCTGGGAC
((..(((((((((((((((.....))...)))))))).))))).))(((((...((((((((.....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))....)))))))).......(((((.....)))))
>90109965 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTTGTCTGGGAC
((..(((((((((((((((.....))...)))))))).))))).))(((((...((((((((.....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))....)))))))).......(((((.....)))))
>90109978 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109982 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109963 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGYGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109981 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGYGACCGTGAAGCGTTTGGCRAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((.(..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...))).)))).......((((....))))
>90109983 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGYGACCGTGAAGCGTTTGGCRAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((.(..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...))).)))).......((((....))))
>90109972 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATYGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109976 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATYGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109986 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATYGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109996 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATYGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109977 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCRTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109970 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTSTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAAYGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109975 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((((((((.....)))))))))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90110001 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTSTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAAYGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((.(((((.....))))).)))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109968 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAASCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((.(((((((((.....)))))))))..))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109974 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAASCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((.(((((((((.....)))))))))..))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109997 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAASCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((.(((((((((.....)))))))))..))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109969 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((((((((.....)))))))))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..((....((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)...))...)))))))).......((((....))))
>90109980 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((((((((.....)))))))))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..((....((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)...))...)))))))).......((((....))))
>90109973 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109987 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
CCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCG
(((.(.((((((....)))))).).....)))....(............).((.(((.(..((((.....))))...))......)).))........(((((((((...))).))))))
>90109988 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
CCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCG
(((.(.((((((....)))))).).....)))....(............).((.(((.(..((((.....))))...))......)).))........(((((((((...))).))))))
>90109999 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGAC
((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((((....)).))))).(.((..(((((((...((((((.((..(.((.(....(((((..(((((.(((...)))..).)))...))))))).)).))))))))))).))))).)).)..((((((....))))))
>90109989 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAACGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...))))))))........(((.....)))
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.