Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (946 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Glomerella cingulata: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; sordariomyceta; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreomycetidae incertae sedis; Glomerellaceae; Glomerella; Glomerella cingulata;
Select All
>24459966 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
>24459967 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
>24459969 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.(((((.((((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
>24459971 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGCGTTGGGGCCCTACGGCTTCCGTAGGCCCCGAAATACAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATACCACCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCCTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((((.(((((...))))))))))))).......(((((((((((((.(((...((((.((((..((........))..))))..)))))))))))))..))).))))..........(((((((...))))))).
>24459970 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCCCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCCTGCCGTAAAACCCCCAAAACTTTTACAGG
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((......)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((..((......))....))))..)))))))))))))..))).)))((((((..........))))))...
>18141012 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGCTGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAACCCCCCAATTTTCC
..........((((((...))))))..(.((((.((((((.....)))))))))).)......((((.((..(((.((((.(..((((.((((.((..(..(...))))))))..))))))))).)))..)))))).(.(((........))).).
>24459968 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTCTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((((.(...).))))).
>17426656 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTTTTTCAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((((((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).))))))..)))..(((.((.....)).))).
>17426673 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTTTTTCAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((((((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).))))))..)))..(((.((.....)).))).
>22653419 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCCTCAAAGGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAAGCCTCCTTTGCGTAGTAAACTTTACCTCTCGCACTGGTGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))).)))......(((.(((((((((((((.(((.(...((((.((((.(((((...)))...))))))..)).)))))))))))..))).)))))...)))..(((((((...))))))).
>17426681 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGTCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTTTACAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..((((((.....)))))).
>27544349 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTG
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((((((...)))))))
>27544351 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTCTCCAAAGGTTG
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((((.(...).)))))
>18141006 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCC
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((.......)))).)
>19909115 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCC
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((.......)))).)
>18141001 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCC
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).......(((((((((((.((((...((((.((((.(((.(...))).)..))))..)))))))))))))..).)))))(.((((........)))).)
>18141011 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCC
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).......(((((((((((.((((...((((.((((.(((.(...))).)..))))..)))))))))))))..).)))))(.((((........)))).)
>27544350 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTG
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...)))))))
>17426675 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>17426678 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGCTGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
>17426680 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGCGTTGGGGCCCTACGGCTTCCGTAGGCCCCGAAATACAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATACCACCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCCTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((((.(((((...))))))))))))).......(((((((((((((.(((...((((.((((..((........))..))))..)))))))))))))..))).))))..........(((((((...))))))).
>17426687 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides f. sp. aeschynomenes Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>17426689 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>17980939 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>18377584 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGCTGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.