Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (478 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Polyporaceae: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Polyporales; Polyporaceae;
Select All
>14269060 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGTTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCTGCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACTTCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.(.((((..(.(...(.(((((((.....)))))))))))))).).)).....).)).......)))))))).).).)))))))))))))))..))))..((..(((.....)))))........
>14269061 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGTTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCTGCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACTTCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((.(((.((((((((((((.(.((((..(.(...(.(((((((.....)))))))))))))).).)).....).)).......)))))))).).).)))))))))))))))..))))..((..(((.....)))))........
>17383597 see NCBI Nucleotide Fibroporia vaillantii Method 2 (see details)
ATGGAATTATCAAACCTTTCTTTAAATTTATTTTAAAGGTTGGCTTGGACTTGGAGGTTGCTGGCCGCGCCATTTTGTAGTCAGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAGTCTTTAATGAGTCGGCTTATCGGTGTGATAAACTTATGCCGTTAGTCAACTTGTAAACAAATCGAGCTTCTAATCGTCTTTGGACAAACATTATAATATGACCTCTGA
.........((((.(...((((((((.....))))))))..)..))))....(((((..((((((((.(....).))......)))))).)))))..........(((((((((...(..(((((.((((.((.((((((......).))))))).)))).).)).)))))...))))))).......(((....))).......................
>17383598 see NCBI Nucleotide Fibroporia vaillantii Method 2 (see details)
ATGGAATTATCAAACCTTTCTTTAAATTTATTTTAAAGGTTGGCTTGGACTTGGAGGTTGCTGGCCGCGCCATTTTGTAGTCAGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAGTCTTTAATGAGTCGGCTTATCGGTGTGATAAACTTATGCCGTTAGTCAACTTGTAAACAAATCGAGCTTCTAATCGTCTTTGGACAAACATTATAATATGACCTCTGA
.........((((.(...((((((((.....))))))))..)..))))....(((((..((((((((.(....).))......)))))).)))))..........(((((((((...(..(((((.((((.((.((((((......).))))))).)))).).)).)))))...))))))).......(((....))).......................
>14269058 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGAACCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCT
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((..(((((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((.(((.....))).)))))))))).).)).....).)).......))))))))...)..)))))))))))))))..))))..(((..(.........))))......
>14269059 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGAACCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((..(((((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((.(((.....))).)))))))))).).)).....).)).......))))))))...)..)))))))))))))))..))))..(((..(.........))))........
>14269066 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGAACCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((..(((((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((.(((.....))).)))))))))).).)).....).)).......))))))))...)..)))))))))))))))..))))..(((..(.........))))........
>14269067 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGAACCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((..(((((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((.(((.....))).)))))))))).).)).....).)).......))))))))...)..)))))))))))))))..))))..(((..(.........))))........
>14269068 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGAACCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((..(((((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((.(((.....))).)))))))))).).)).....).)).......))))))))...)..)))))))))))))))..))))..(((..(.........))))........
>14269069 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACATCCTTGTGATGTTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTCGGGNNNGGACGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCT
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((.(((((.(......((.((((((.(.((((..(.(...(.(((((((.....)))))))))))))).).)).....).)).......).)))))).).).)))))))))))))))..))))..((..(((.....)))))......
>14269070 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACATCCTTGTGATGTTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCT
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((.(((((.((((((((((.(.((((..(.(...(.(((((((.....)))))))))))))).).)).....).)).......)))))))).).).)))))))))))))))..))))..((..(((.....)))))......
>14269071 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGTTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCTGNGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACTTCTTGACATCTGA
.(((.....))).(((.((((((.....)))).)).)))...(((((((((((((((((((.(((.((.(((((((((.(.((((..(.(...(.(((((((.....)))))))))))))).).)).....).)).......)))).))).).).)))))))))))))))..))))..((..(((.....)))))........
>14269073 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 2 (see details)
ATGNAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGTNGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCTGCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACTTCTTGACATCTGA
.........(((((((.((((((.....))))).).))).)))).((.(((((...((((((((...).))))))).))))).)).......((((((...((((((...((((.((.(((((((((....))).)))))).))))).)..)))..))))))))).......(((((....))))).................
>14269074 see NCBI Nucleotide Pycnoporus cinnabarinus Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGATGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTTGTGGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGNANCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAATCGTCCCATAAGGGACAACAAACCTTGACATCTGA
.........(((((((.((((((.....)))).)).))).))))(((.(((((...(((.(.(((...))).)))).))))).)).).....((((((...(((.(((..((((.(..(((((((((....))).)))))).).))))....)).).))))))))).....(.(((((....))))).).................
>18478518 see NCBI Nucleotide Polyporus alveolaris Method 3 (see details)
AATCATCAACTTTTAGGCCTTTTATGGGCTCTATAAGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCGGTCAACGTTGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTATGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCGAACCGTCTCGTGAGAGAC
((...(((((((..(((.(((....))).)))..))).))))..))(((((...(((((((.....))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......(((((....)))))
>18478521 see NCBI Nucleotide Polyporus arcularius Method 3 (see details)
TTAACGGGACTTGCTTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCTGCTTAGCAGTCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCACGGTGTGATAATTATCTGCGCCGCGACCGTTGAAGCGTTTAATGGCCAGCTTCTAATCG
(((((..((.....))..).))))....((((....((((((.........))))))..))))....(((.(((...................((....((((..(((....)))...))))...))..))).))).....(((..((...))..)))
>15027238 see NCBI Nucleotide Trichaptum abietinum Method 3 (see details)
TCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTACTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACA
(((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).)))))..........(((..(((((((.((((((.((((((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))).....))))))))))......((((....))))
>15027237 see NCBI Nucleotide Trichaptum abietinum Method 3 (see details)
TCAACCCCGTCGGTTTGTAAATCAGACCGTTGGGTGTTGGACTTGGAGGTTCTTGCTGGCTGCAAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGGGCCTGTTGTGCGTGCTCGCGGTGTAATAAGTTTTATTCATCGTTTGGGTCGTACACTTATTGGGCTTGCTTCTAACTGTCTTCGGACA
(((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))))....(((((.....(((((((....))))))).)))))..........(((..(((((((.((((((.((((((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))).....))))))))))......((((....))))
>14269062 see NCBI Nucleotide Pycnoporus coccineus Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCTGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCTGA
.........((((((((((((((.....)))).)))))).))))....(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....))))).................
>14269063 see NCBI Nucleotide Pycnoporus coccineus Method 1 (see details)
ATGGAACTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCTGCGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTGGCCCTAGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCTGA
.........(((((((.((((((.....)))).)).))).)))).((.(((((...(((((((......))))))).))))).)).......((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....))))).................
>14269064 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCTGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCCCTTGACATCTGA
.........((((((((((((((.....)))).)))))).))))....(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....))))).................
>14269065 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCTGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCTGA
.........((((((((((((((.....)))).)))))).))))....(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....))))).................
>14269072 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCTGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCGTCGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCTCTTGACATCTGA
.........((((((((((((((.....)))).)))))).))))....(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....))))).................
>14269075 see NCBI Nucleotide Pycnoporus sanguineus Method 1 (see details)
ATGAATTCTCAACCCACACGTCCTTGTGATGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCCTCGTGGTCGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTGTATGGGACAACCCTTGACATCT
........(((((((((.((((.....)))).))))).))))....(((((...(((((((.....))))))).)))))..........((((((...(((.((....(((.((.(((((((((....))).)))))).)))))....))...))))))))).......(((((....)))))..............
>15215977 see NCBI Nucleotide Fibroporia vaillantii Method 1 (see details)
ATGGAATTATCAAACCTTTCTTTAAATTTATTTTAAAGGTTGGCTTGGACTTGGAGGTTGCTGGCCGCGCCATTTTGTAGTCGGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAGTCTTTAATGAGTCGGCTTATCGGTGTGATAAACTTTATGCCGTTAGTCAACTTGTAAACAAATCGAGCTTCTAATCGTCTTTGGACAAACATTATAATATGACCTCTGAC
.........((((.((..((((((((.....))))))))..)).))))....(((((..(((((((((..((...))..).)))))))).)))))..........(((((((....((.((((((.((((...((((((((......))))))))..)))).)))))).))....))))))).......(((...((.((............)).))...)))
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.