Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (4451 hits, page 2)

Show entries per page   << Previous    Next >>

Lineage of Russulales: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Russulales;
Select All
>6563327 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563328 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563329 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGGGACAACGACTTTTAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563331 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGGGACAACGACTTTTAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563332 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATAAACGGGGATTGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGATAACGACTTTTAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......)))).))))).......(((((....))))).................
>6563323 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563324 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>6563325 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((..(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....))))).................
>5734056 see NCBI Nucleotide Gloeoporus pannocinctus Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCATCCCCTAAATTTATTTTTGGTGGGCTTGGATGTGGAGGTTGTGCCGGTTTGTTAAAAGCCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGTGAATCTTACTGATCGCCTTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTGGTTGTGAAGTAAATTAATGTTCATGCTTCTAATCGTCTCTTTTTGAGACAATTACTTTGACATCTGA
.........(((.((((((((......))))).)))..)))....(((((....((((((((.....)))))))).)))))..........(((((((((.(((((.((.(((..(((((((((....))).)))))).))).))..)))))......)))))))))..((((.(((((.....))))).)))).............
>4808573 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces eludens Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAAAAACATAAATAAAAGAAAAGCTTTTACCGGCAGAWTTTTTTGGATTGGTTTAAGGACTTGAAGGTTGTGTCGGCTACTAGCTTTAGTAAGACTCCTCTGAAACGCATTAGTATGAACCTTACGGATCACTTATCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTAGTTGTGAAGTATTTATGTGCTCATGCTTACAATTGCTTAGTTGTCTTTGAAAAAAAAAAGACGACGGCGTTATGACATCTG
.......(((...((((.(((.(((((((..((((......)))...))))))).).)))))))..))).(((.(((..(.(((...(((((....))))).))))))).)))...((((.((((((....((((...((((..(((((((((((....))).)))))).).).)))).)))...))))))).))))...((.(((((..(((((((((........)))))))))))))..))).......
>6563326 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAACCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTATAACTTGA
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((..((((((((...)..))))))).))))).)).......(((((.((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))))......)))..))))).......(((((....))))).................
>4808577 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces serpens Method 3 (see details)
TCCCCCMAGAGAATTTTTTTATTCTGCGGGCTTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTCTAGCTCAGTCGACTCCTCTAAAATGTATTAGCGTGAATCTTACGGATCGCCTTCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTGGCTGTGAAGTATTTAATTGACTCATGCTTACAATCGTCTCTTGGGAGACAGTTTATA
((...(...((((........))))....)...))..(((((((....(((((((.......))))))).)))))))...((((.((.(((((((((.((....(((..(((((((((....))).)))))).)))..))))).)))).))...)).)))).((.((..(((((....)))))...)).))
>6563330 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 3 (see details)
TCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAATCAATGGGGAATCGCTTC
((..(((((....)))))..........))....((((...(((((...........)))))..))))......(.(((..............(((...(((..(((....)))...)))...)))))).)..........(((....)))
>6013194 see NCBI Nucleotide Hericium coralloides Method 3 (see details)
TCAATCCTCTTGTCATGAGAGGGCTGGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCCGGTGCTCCCTCGGGAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATGAGTGGATCCCTTTTGTAGGGTTTGCCCTTGGTGTGATAATTATCTACGCCGCAG
((((.(((..(.(.......).)..))).)))).(((((.((..(.......)..)).))))).....((.((.....((((((....))).......)))...)).))...(..(((((((((....))).))))))..)
>4929367 see NCBI Nucleotide Hericium erinaceum Method 1 (see details)
GTGAAATTCTCAACTCAATCCTCTTGTTATGAGAGGGCTGGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCCGGTGCTCCCTCGGGAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATGAGTGGATCCCTTTTGTAGGGTTTGCCCTTGGTGTGATAATTATCTACGCCGCGGGTAGCCTTGCGTTGGTCTGCTTCTAACCGTCTTCGGGCAACTTTCATCTCAACT
.........((((((((.(((((((.....))))))).)))).))))....(((((....((((((..(((....))).)))))).))))).........(((((((((.....(((((((((.((((.(((((((((....))).)))))).)))))))))))))..)))))))))......(((....)))................
>4808568 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces microsporus Method 1 (see details)
ATGAAATTCTCAAGTCAGTAGATTTTTTAATCTGCATGACCTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTTCATCTGTCGACTCCTCTGAAATGCATTAGCGCGAACGTTTACAAATTCAGTGTGATAATTATCTGYGCTGTCGTTGTTAACTGTCTCCTGCTTTACCGTCTTTTAAAGACAATTTTTGACATCTGA
.........(((.(((((((((((....))))))).)))).)))..(((((((....((((((.......)))))).)))))))........((((.(((((((.((((...((((..(((....)))...))))...)))).))).)).)).)))).....(((((...)))))................
>4808569 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces microsporus Method 1 (see details)
ATGAAATTCTCAAGTCAGTAGATTTTTTAATCTGCATGACCTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTTCATCTGTCGACTCCTCTGAAATGCATTAGCGCGAACGTTTACAAATTCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTCGTTGTTAACTGTCTCCTGCTTTACCGTCTTTTAAAGACAATTTTTGACATCTGA
.........(((.(((((((((((....))))))).)))).)))..(((((((....((((((.......)))))).)))))))........((((.(((((((.((((...(((((((((....))).))))))...)))).))).)).)).)))).....(((((...)))))................
>4808570 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces microsporus Method 1 (see details)
ATGAAATTCTCAAGTCTGTAGATTTTTTAATCTGCATGACCTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTTCATCCGTCGACTCCTCTGAAATGCATTAGCGCGAACGTTTACAAATTCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTCATTGTTAACTGTCTCCTGCTTTACCGTCTTTTAAAGACAATTTTTGACATCTGA
.........(((.(((((((((((....)))))))).))).)))..(((((((....((((((.......)))))).)))))))........((((.(((((((.((((...(((((((((....))).))))))...)))).))).)).)).)))).....(((((...)))))................
>4808571 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces microsporus Method 1 (see details)
ATGAAATTCTCAAGTCAGTAGATTTTTTAATCTGCATGACCTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTTCATCTGTCGACTCCTCTGAAATGCATTAGCGCGAACGTTTACAAATTCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTCGTTGTTAACTGTCTCCTGCTTTACCGTCTTTTAAAGACAATTTTTGACATCTGA
.........(((.(((((((((((....))))))).)))).)))..(((((((....((((((.......)))))).)))))))........((((.(((((((.((((...(((((((((....))).))))))...)))).))).)).)).)))).....(((((...)))))................
>4808572 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces eludens Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAAAAACATAAATAAAAGAAAAGCTTTTACCGGCAGATTGTTTTGKTTTGGTTTAAGGACTTGGARGTTGTGTCGGCTACTARCTTTAGTAAGACTCCTCTGAAACGCATTAGTTTGAACCTTACGGATCRCTTATCAGTGTGATAATTAACTGCGCTGTAGTTGTGAAGTATTTATGTGCTCATGCTTACAATTGCTTAGTTGTCTTTGAAAAAGAAAAAGACGACGGCGTTATGACATCTG
...((.((((.(((....((((.((((.((..(((......)))...)).))))..)))).))).)))).)).........(((.((((.......))))..)))...........((((.(((.(((((.((((((.........(((((((.........)))))))...)))))).))..)))...))).))))...((..((((..(((((((((.........)))))))))))))...)).......
>4808574 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces eludens Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAAAAACATAAATAAAAGAAAAGCTTTTACCGGCAGATTGTTTTGTTTTGTTTTTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTACTAGCTTTAGTAAGACTCCTCTGAAACGCATTAGTATGAACCTTACGGATCACTTATCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTAGTTGTGAAGTATTTATGTGCTCATGCTTACAATTGCTTAGTTGTCTTTGAAAAAAAAAGAGACGACGGCGTTATGACATCTG
.........(((((((((.((((((((.((..(((......)))...)).)))))))))))))))))..(((((((....(((...(((((....))))).))).)))))))...((((.((((((.....(((...((((....(((((((((....))).)))))).....)))).)))....)))))).))))...((..((((..(((((((((.........)))))))))))))...)).......
>4808575 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces eludens Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAAAAACATAAATAAATAAAAAGAAAGGCTTTCACCGGCAGTTTTTTTTGTTATGTTGTTTTTGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTACTAGCTTTAGTAAGACTCCTCTGAAATGCATTAGTATGAACCTTACGGATCACTTATCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTAGTTGTGAAGTATTTAATGTGCTCATGCTTACGATTGCTTAGTTTGTCTTTGAAAAGAGATAAGCAGAAGCTTTTATGACGTCTGG
.........(((((((((...((((.(((((((((..(((......)))..)))))))))))))..)))))))))..(((((((....(((...(((((....))))).))).)))))))...((((.((((((.....(((...((((....(((((((((....))).)))))).....)))).))).....)))))).))))....((..((((.((((((((((....))))))))))..))))..))...........
>4808576 see NCBI Nucleotide Ceraceomyces eludens Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAAAAACATAAATAAAAGAAAAGCTTTTACCGGCAGATTTTTTTGTTTTGTTTTNGGACTTGGAGGTTGTGTCGGCTACTAGCTTTAGTAAGACTCCTCTGAAACGCATTAGTATGAACCTTACGGATCACTTATCAGTGTGATAATTATCTGCGCTGTAGTTGTGAAGTATTTATGTGCTCATGCTTACAATTGCTTAGTTGTCTTTGAAAAAAAAAAGACGACGGCGTTATGACATCTGG
.......(((..((((((.(((((((((((..(((......)))...))))))))))))))))).))).(((((((....(((...(((((....))))).))).)))))))...((((.((((((.....(((...((((....(((((((((....))).)))))).....)))).)))....)))))).))))...((..((((..(((((((((........)))))))))))))...))........
>4761519 see NCBI Nucleotide Hericium erinaceum Method 1 (see details)
GTGAAATTCTCAACTCAATCCTCTTGTTATGAGAGGGCTGGGCTTGGACTTGGAGGTCTTGCCGGTGCTCCCTCGGGAAGTCGGCTCCTCTTGAATGCATGAGTGGATCCCTTTTGTANGGTTTGCCCTTGGTGTGATAATTATCTACGCCGCGGGTAGCCTTGCGTTGGTCTGCTTCTAACCGTCTTCGGACAACTTTCATCTCAACT
.........((((((((.(((((((.....))))))).)))).))))....(((((....((((((..(((....))).)))))).))))).........(((((((((.....((((.((((.((((.(((((((((....))).)))))).)))))))).))))..)))))))))......(((....)))................
>4539780 see NCBI Nucleotide Peniophora pithya Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCCCTACCTTCTTCGGAAGGTATCGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCAGAGCCCTCGCGGCCTTGGTGTGATAATCATCTACGCCTCGGTTTAGCGCATGAACGGGCATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGGGACAACGACTACCAAC
.........((((.(((.(((((((....)))))))..))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((.((((.(((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......)))).))))).......(((((....))))).............
Select All

Show entries per page   << Previous    Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.