Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; dothideomyceta; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales; Mycosphaerellaceae; Mycosphaerella; environmental samples;
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>12407349 see NCBI Nucleotide uncultured Mycosphaerella clone LDG1 Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCGTGGTATTCCGCGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCACCACTCAAGCCTAGCTTGGTATTGGGCGC
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Polyporales; environmental samples;
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>11118845 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq51 Method 2 (see details)
AAGTCATCAACCGCTCCCGTTTGAAAGCGGGGGGCCGGGTTGGATCTGGGGGCTTGCCGCTGCAAAGCGGCTCCCTTCAAATGCATCGGTTGGACCTGTGGGTCGAACTCGAGTGGGCGTTGTAACATCCTCGCTCTACCGAGAGGTTCCCCTTTGGCGTCCTCCCACGACTCGCCTGTGGAGTGGCGGTCAATTTGCTTTGAAATCT
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>11118846 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq52 Method 2 (see details)
AAGTCATCAACCGCTCCCGTTTGAAAGCGGGGGGCCGGGTTGGATCTGGGGGCTTGCCGCTGCAAAGCGGCTCCCTTCAAATGCATCGGTTGGACCTGTGGGTCGAACTCGAGTGGGCGTTGTAACATCCTCGCTCTACCGAGAGGTTCCCCTTTGGCGTCCTCCCACGACTCGCCTGTGGAGTGGCGGTCAATTTGCTTTGAAATCT
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>11118847 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra1092C Method 2 (see details)
TTGAAGTCATCAACCGCTCCCGTTTGAAAGCGGGGGGCCGGGTTGGATCTGGGGGCTTGCCGCTGCAAAGCGGCTCCCTTCAAATGCATCGGTTGGACCTGTGGGTCGAACTCGAGTGGGCGTTGTAACATCCTCGCTCTACCGAGAGGTTCCCCTTTGGCGTCCTCCCACGACTCGCCTGTGGAGTGGCGGTCAATTTGCTTTGAAATCTGA
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; environmental samples;
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>12407348 see NCBI Nucleotide uncultured fungal clone p4-4 Method 3 (see details)
TCCAAAACCCTGCTTTACCGCGGGCGTTTCGGGTGTTGGACCGCGTTGGACCGTTCGCGGCCAACTGGTCTCAAAGACAATGACGGGCGTCCATGGGGACCCTCTTCGCACTGAGCTTTCCGGAGCACGCGTCGAGTTGCAAGGTCTTGTGGGCCCGGCCACCTCTAAATCTATTTTTTCAGG
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; environmental samples;
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>11118820 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq46 Method 2 (see details)
ATTATCAACCATCAAGCCTGGCTTGTCGTTGGACTCTTTTTACCGCTGAAATATGTGGTAGGTCCGAAAGATAATGACGGCGTCGTGTTTGACCCTAGATGCAACGAGCTTTTTATAGCACGCATTGAAGTGGTCGACCGACCCGGTCTTTAACCATCATTTTCTAAGGTT
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>11118821 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq66 Method 2 (see details)
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>11118822 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq53 Method 2 (see details)
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>11118840 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra14424 Method 2 (see details)
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>11118856 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra15222 Method 2 (see details)
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>10998474 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1041.3 Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCGAGCCCCCCCCGGGGGCCTCGGTGTTGGGGGACGGCACACCAGCCGCCCCCGAAATGCAGTGGCGACCCCGCCGCAGCCTCCCCTGCGTAGTAGCACACACCTCGCACCGGAGCGCGGAGGCGGTCACGCCGTAAAACGCCCAACTTTCTTAGAGTTGA
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>10998475 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1522.5 Method 2 (see details)
ATCTAAACCCTCAAGCACTGCTTGGTGTTGGGCGCTTGTCCCGCCTCGGGCGCGGACTCGCCTCAAAAGCATTGGCGGCCTGTGTAATTGGCTTCGAGCGCAGCAGACTCGCGCCTCGCAAACCACTGGCACGGGCGTCCATCAAGACAACCCCCCCAAGTTTGA
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>10998472 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1542.5 Method 1 (see details)
ATTTAGTCCACTTAAGCCTTTTGCTTAGTATTGGGAATCTACTTTTACCTTGGTAGCTGTAGTTCCTCAAAGACAGCGGCGGAGTCGTGGTTTTACTCTGAGCTTAGTAATTTTTTTCTAGCTTTCGAGTCGCCACTGCCCCCTTGCCGTAAAACACCCTTTATTTTTTAATGGTTGA
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>10998473 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1542.2 Method 1 (see details)
ATTTAGTCCACTTAAGCCTTTTGCTTAGTATTGGGAATCTACTTTTACCTTGGTAGCTGTAGTTCCTCAAAGACAGCGGCGGAGTCGTGGTTTTACTCTGAGCTTAGTAATTTTTTTCTAGCTTTCGAGTCGCCACTGCCCCCTTGCCGTAAAACACCCTTTATTTTTTAATGGTTGA
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>11118815 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra1011.13 Method 1 (see details)
ATTACAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTAGGCCTTACCTGCTACAGGCAGGCCGTAAAATCAGTGGCGGTGCCTTTCGGCTTCAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTTCGGAGTACCGGTTGCGTGCCTGCTATAAAACCCCAATTTTGTCAAAGGTTGA
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>11118819 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq62 Method 1 (see details)
ATTTCACCACTCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCAACGCGGTCCGCCGCGTGCCTCAAATCGTCCGGCTGGGTCTTCTGTCCCCTAAGCGTTGTGGAAACTATTCGCTAAAGGGTGTTCGGGAGGCTACGCCGTAAAACAACCCCATTTCTAAGGTT
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>11118832 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq67 Method 1 (see details)
ATTACAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTAGGCCTTACCTGCTACAGGCAGGCCGTAAAATCAGTGGCGGTGCCATTCGGCTTCAAGCGTAGTAAATTTTCTCGCTTCGGAGTACCGGTTGCGTACCTGCTATAAAACCCCAATTTTTTATAAAGGTT
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>11118844 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq68 Method 1 (see details)
ATTGCAACCCTCAAGCACTGCTTGGTGTTGGGCGGTACCGCGCGCGGTACGCCTCAAACTCAGTGGCGGCGCCACCCGGCTTCAAGCGTAGTAGCACTTCTCGCTTCGGACGCCGGGCGCGCTCCCGCCAGCAAGCCTCACTTCTCAAGGTT
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Sebacinales; Sebacinaceae; Sebacina; environmental samples;
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>11118853 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq7 Method 2 (see details)
GTAATCTCACTACCGTTGACTGTTTTGTCTTTCGGTATGTGGACTTGGATGTTGCCGTCGATGTCTACGGCTCGTCTGAAATGCTTCAGTGTACCCCGCTTTGCGGCGTATTCGGTGTGATACATCTTCACCGGAGTTGATCCCTTTGGGGGTCGCGTCTGTAATGTGTGGCTCTATGCTTCCAACCGTCTCTTGAGACAATCTCTGACAATTT
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>11118858 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra15029 Method 2 (see details)
ATTGTAATCTCACTACAATCGACTTTTGTCTTTTCGTATGTGGACTTGGATGTTGCCGTGAATAAACAAACGGCTCGTCTGAAATGTCTGAGTGTACCCCGCTTTGCGGCGTATTCGGTGTGATAAATCTTCACCGGAGTTGATCCCTTTATGGGGGTCGCGTCTGTAACGGTGTGGCTCTATGCTTCAAACCGTCTCCAATCGAGACAAAATTCTGACAATTT
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>11118859 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra14423 Method 2 (see details)
ATTGTAATCTCACTACGATCGACTTTTATGTCTTTCCGTATGTGGACTTGGATGTTGCTGTGGATATCTATGGCTCATCTGAAATGCTTCAGTGTACCCCGCAAAGCGGCGTATTCGGTGTGATACATCTTCACCGGAGTTGATCCTTTACGGGTCGCGTCTGTAATGTGTGGCTCTATGCTTCAAACCGTCTTGATAGGACAATCTTTGACAATTC
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>11118860 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra14421 Method 2 (see details)
ATTGTAATCTCACTACGATCGACTTTTATGTCTTTCCGTATGTGGACTTGGATGTTGCTGTGGATATCTATGGCTCATCTGAAATGCTTCAGTGTACCCCGCAAAGCGGCGTATTCGGTGTGATACATCTTCACCGGAGTTGATCCTTTACGGGTCGCGTCTGTAATGTGTGGCTCTATGCTTCAAACCGTCTTGATAGGACAATCTTTGACAATTC
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>11118855 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq70 Method 3 (see details)
GTTGACTGTTTTGTCTTTCGGTATGTGGACTTGGATGTTGCCGTCGATGTCTACGGCTCGTCTGAAATGCTTCAGTGTACCCCGCTTTGCGGCGTATTCGGTGTGATACATCTTCACCGGAGTTGATCCCTTTGGGGGTCGCGTCTGTAATGTGTGGCTCTATGCTTCCAACCGTCTCTTGAGAC
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; environmental samples;
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>11118862 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra1456C Method 2 (see details)
GTGGTATCATCGAACCCCACCGTTTTGCGACGGTGGCGGCTCGGACTTGGAGGCGTTGCCGGGCCTTTTCTGAAGGCTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGCTGGGACTCTTGTCCGAGGGCTCTGACGTGATAGTGATGTTGCGTCGTGGTCCGAGGGCTTTGTGTGGTCGCCGCTTCCAATCGTCCGCGAGGACTGTATGGTGTTTTTTTTTCGAAACACCTTTTGACCTTTGA
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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; sordariomyceta; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreomycetidae incertae sedis; Glomerellaceae; Glomerella; environmental samples;
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>12407346 see NCBI Nucleotide uncultured Glomerella sp. p2-6 Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCC
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Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

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