Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (631 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Corticiaceae: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Corticiales; Corticiaceae;
Select All
>4235188 see NCBI Nucleotide Butlerelfia eustacei Method 2 (see details)
ATGAAATCATCAACCACGATGCTTCTTAGTGTCGCTGGCTTGGACTTGGGGATCTGCTGGCTTGTCAAGAGTCGGCTTCCCTTGAATGCATTAGTCGGGTGCCTTGCTCGAGAAGTGTGATAATTATCATTCACTGATCGTCGAGGAGCTTTGTCTCGGCTTCTAACCGCATTGGAAACGATGCAATTTTGAACATCTGA
.........(((((((((((((.(...))))))).))).))))..(((((((...((((((((.....)))))))))..)))))).......((((((((((((((..(((..((((((((....))))..))))..))).))))).....)).))))))).......(((((.(...))))))................
>4539767 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. B Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGGAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((...((((((((...)..))))))).))))).)).......(((((.((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......))).)))))).......(((((....))))).............
>4539771 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. H Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACTTAATGGGACTCGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((...((((((((...)..))))))).))))).)).......(((((.((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......))).)))))).......(((((....))))).............
>4539781 see NCBI Nucleotide Dendrophora albobadia Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCAGGTCCCTGGTTGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTCGCGGCCTTGGTGTGATAATTATCTGCGCCTTGGCTTAGCGAACCTATAGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTTCAAAC
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((...((.(((((...)..)))).)).))))).)).......(((((.(((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))))......))).)))))).......(((((....))))).............
>5070527 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).)))..))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070529 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).))........................
>5070530 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGA
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070533 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTCTGAATAGTGATTAGCTCGGAATTTGATTCGCAGCATATCATGCGGTGTGATAATGTCGTCACATGCTGTAGCTCGGATTCTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGA
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).)))))..)..........((((.(((....((((((.(((...(.((((((((((((...)))).))).)).))))))))))))).)))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070534 see NCBI Nucleotide Hyphodontia paradoxa Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTGTTGAAAGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTGCTGGTTTTCAATCAGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGACTTTGATTTGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCAAGTCGTTTGGCTTCTAATCGTCCTTTCACGAGGACATTCTGATCAATTAGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((...(((((((...))))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.((((((....))))))).).))).........................
>5070535 see NCBI Nucleotide Hyphodontia paradoxa Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTGTTGAAAGGTGAGCTTGGACTTGGGGACTTGCTGGTTCTCAATCAGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGACTTTGATTTGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCAAGTCGTTTGGCTTCTAATCGTCCTTTCACGAGGACATTCTGATCAATTAGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((...(((((((...))))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.((((((....))))))).).))).........................
>5070536 see NCBI Nucleotide Hyphodontia flavipora Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCTATTCTTTATTGAATGGTGAGCTTGGATTTGGAGATTGCTGGTGAAAATCGGCTTCTCTTGAATGAATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCTTTCATGGACAATTTGATCATTTTGACCTCAAATCAGGTAGA
.........(((((((((((((......)))))).))).)))).((.(((((..((((((....)))))).))))).)).......(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.((((.....)))).))).)).........................
>5070537 see NCBI Nucleotide Hyphodontia flavipora Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCTATTCTTTATTGAATGGTGAGCTTGGATTTGGAGATTGCTGGTGAAAATCGGCTTCTCTTGAATGAATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGGTTGTCTGGCTTCTAATCGTCTTTCGTGGACAATTTGATCATTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).)))).((.(((((..((((((....)))))).))))).)).......(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.((((.....)))).))).)).........................
>5070538 see NCBI Nucleotide Hyphodontia flavipora Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCTATTCTTTATTGAATGGTGAGCTTGGATTTGGAGATTGCTGGTGAAAATCGGCTTCTCTTGAATGAATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCTTTCATGGACAATTTGATCATTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).)))).((.(((((..((((((....)))))).))))).)).......(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.((((.....)))).))).)).........................
>5070528 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070531 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070532 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>5070539 see NCBI Nucleotide Hyphodontia radula Method 2 (see details)
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG
.........(((((((((((((......)))))).))).))))..(.(((((..((((((....)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).)).........................
>4539763 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. E Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539764 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. E Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539765 see NCBI Nucleotide Entomocorticium dendroctoni Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTACCGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539766 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. F Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACGTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539762 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. D Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539768 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. A Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGACTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTAATGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.............((((((((((((....)))))...))))..))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539769 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. C Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATACGGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539770 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. G Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))...........)))..))))).......(((((....))))).............
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.