The ITS2 database

Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.

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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (85 hits, page 1)

Lineage of Cryptococcus gattii: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Tremellomycetes; Tremellales; Tremellaceae; Filobasidiella; Filobasidiella/Cryptococcus neoformans species complex; Cryptococcus gattii;

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>223047813 Cryptococcus gattii Method 1 (see details) ATGAAAATCTCAATCCCTCGGGTTTTATTACCTGTTGGACTTGGATTTGGGTGTTTGCCGCGACCTGCAAAGGACGTCGGCTCGCCTTAAATGTGTTAGTGGGAAGGTGATTACCTGTCAGCCCGGCGTAATAAGTTTCGCTGGGCCTATGGGGTAGTCTTCGGCTTGCTGATAACAACCATCTCTTTTTTGTTTGA ....(((((.((((((..(((((......)))))..))).))))))))(((((...((((((.(((....))).)).)))).))))).......(((((((((..((.((((((((....((((((((.((....)).)))))))).....)))))))).))..)))))))))..(((.((.........)).))).

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>167444549 Cryptococcus gattii Method 2 (see details) ATGAAAATCTCAATCCCTCAGGTTTTATTACCTGTTGTGACTTGGATTCTGGCGTGTCTTGCCGCGACCTGCAAAGGACGTCGGCTCGCCTTAAATGTGTTAGTGGGAAGGTGATTACCTGTCAGCCCGGCGCTATATAAGTTTCGCTGGGCCTATGGGGTAGTCTTCGGCTTGCTGATAACAACCATCTCTTTTTGTTT .....((((.((((((..(((((......)))))..).)).)))))))..((((.(....((((((.(((....))).)).)))))))))........(((((((((..((.((((((((..((((((((((..(.(....)).)))))))).)..))))))))).))..)))))))))...((.((........)).))

>304472 Cryptococcus gattii Method 2 (see details) ATGAAAATCTCAATCCCTCGGGTTTTATTACCTGTTGGACTTGGATTTGGGTGTTTGCCGCGACCTGGAAAGGACGTCGGCTCGCCTTAAATGTGTTAGTGGGAAGGTGATTACCTGTCAGCCCGGCGTAATAAGTTTCGCTGGGCCTATGGGGTAGTCTTCGGCTTGGTGATAACAACCATCTCTTTTTTGTTTGA ....(((((.((((((..(((((......)))))..))).))))))))(((((...((((((.(((....))).)).)))).))))).......((((.((((..((.((((((((..((((((((((.((....)).)))))))).)..))))))))).))..)))).))))..(((.((.........)).))).

>167444552 Cryptococcus gattii Method 3 (see details) GCTAATGTGAATTGCAAGAGATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTTGAGAGTCATGAAAATCTCAATCCCTCAGCGTTTTATTACTCTGTTGGACTTGGATTTGGGTGTTT (.((((....))))).....((((.(((...))).))))..(((((((....(...(((((((((....))))))))))....))))))).((.(........(((((...((.(((.......((......))).)).))..))))).).))

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Id	Description*
1	Unafold - Direct
2	Homology modeled
3	Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

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