Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (62 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Emericella nidulans: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; Eurotiomycetes; Eurotiomycetidae; Eurotiales; Trichocomaceae; Emericella; Emericella nidulans;
Select All
>2072177 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTGGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATCTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((...((((....))))))))))))....(((.((((((((.((((.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>21666933 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGACTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTCTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...((((.(........)))))..
>2315 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGCACCGTGTCCGGTCCTGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((...))))))))))))....(((.(((((((.(((.(.(((((((((((((...(((((...))).))))))).)...)))))))))))..))..)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>25991648 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
GCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGG
.......((((((...))))).)....((((..(((((((((...))))))))))))).........(((((((.(((.(((.(.((((.(((((...(((((...))).))))))...).))))).))))))..))).))))...........((((...)....)))
>34809368 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>4927230 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>91680620 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>82491473 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTCTTCAGGTTGA
......(((((((((((...))))).)...)))))..((((((((....)))))))).......((((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))).(((((....(....)))))).
>82491474 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTCTTCAGGTTGA
......(((((((((((...))))).)...)))))..((((((((....)))))))).......((((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))).(((((....(....)))))).
>82491475 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTCTTCAGGTTGA
......(((((((((((...))))).)...)))))..((((((((....)))))))).......((((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))).(((((....(....)))))).
>38427151 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCCAACCATTTTTCTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))....)))))))))))..))).)))).)))).((((.(........)))))..
>21666853 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>21666939 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>82491501 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>82491503 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>82491504 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>82491505 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>83627155 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTTTCAGGTTGA
......(.(.(((((((...))))).))).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(...((((.....)))))..
>3757578 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTATGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGATCCTCGAGCGTATGGGGCTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTTATTTTTCTCAGGTT
......((...(((((...))).)).)).(((((((.(.((((((....))))))))))))))..(((..(((((((.(((.(.((((.((((((((((...((((....)).))))))))...)))))))))))).))).))))))..)...(((((..(...)....)))))
>4092047 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCAAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCACCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGG
..........((((((...))))).)....(((((.(.((((((...))))).))))))).........(((.(((.(((.(((.(.((((.(((((...(((((...))).))))))...).))))).))))))..)))..)))...........((((...)....)))
>4092048 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCACCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGG
..........((((((...))))).)....(((((.(.((((((...))))).))))))).........(((.(((.(((.(((.(.((((.(((((...(((((...))).))))))...).))))).))))))..)))..)))...........((((...)....)))
>424139 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTTCCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))..
>25991624 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
GCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGG
........(((((...))))).((.(((((((.(.(((......))....)))))))..)).))..(((((((.((.((((.((((((.(((((.....((...(...)))))))....)))))))))).))).))).))))................(((....)))
>56117963 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
GCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGG
........(((((...))))).((.(((((((.(.(((......))....)))))))..)).))..(((((((.((.((((.((((((.(((((.....((...(...)))))))....)))))))))).))).))).))))................(((....)))
>7208819 see NCBI Nucleotide Emericella nidulans Method 2 (see details)
ATTGCTGCCCTCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGATTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGGCGTCTCCAACCTTATTTTTCTCAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGA
......((..((((((...))))).).).)(((((..(((((((....))))))))))))....(((.((((((((.(((.(.((((((((((((((...(((((...))).)))))))))...)))))))))))..))).)))).))))...(((((.(...)....)))))....................
Select All

Show entries per page      Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.