Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (14 hits, page 1)

Show entries per page

Lineage of Entomocorticium: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Corticiales; Corticiaceae; Entomocorticium;
Select All
>74049266 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. SL-A3 Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCTGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTAACGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).................
>74049267 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. SL-W002 Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCTGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTAACGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).................
>326319948 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. ZK25/08 Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTACCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATACGGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).................
>4539767 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. B Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGGAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((...((((((((...)..))))))).))))).)).......(((((.((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......))).)))))).......(((((....))))).............
>4539771 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. H Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACTTAATGGGACTCGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((..(.(((((....))))).)..))).)))).((.(((((...((((((((...)..))))))).))))).)).......(((((.((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......))).)))))).......(((((....))))).............
>314912608 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. AZF001 Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTTGCAAGAGACAACTACTACCAACTTGA
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).................
>4539763 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. E Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539764 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. E Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539765 see NCBI Nucleotide Entomocorticium dendroctoni Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTACCGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539766 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. F Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACGTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539762 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. D Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539768 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. A Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGACTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACTTAATGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.............((((((((((((....)))))...))))..))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..)))).......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539769 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. C Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATACGGGGACTTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....))))).............
>4539770 see NCBI Nucleotide Entomocorticium sp. G Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGTACCGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACTACTACCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))...........)))..))))).......(((((....))))).............
Select All

Show entries per page


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.