Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (22 hits, page 1)

Show entries per page

Lineage of Ganoderma adspersum: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Polyporales; Ganodermataceae; Ganoderma; Ganoderma adspersum;
Select All
>158934556 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGT
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))....
>158934559 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGT
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))....
>164514094 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTYGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>158934560 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCT
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))................
>291359248 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTATAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGCCCTCGGCTCTCGGTGTGATAATATCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCACTTGAGAGACAACTTTATGACCTCTGA
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...)..))))))).)))))........((((...(.((((.(((....((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(.(((.....))).)..).)))......
>3688305 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCCCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTATGACCTCTGA
.((((...)))).((((((((((.((...))))))))))))..((((((((((((((((((((.((((.((((((((.((.(.((.(...((...(.((((.(((.....))))))))))).)).).).....).)).......)))))))))..).)))))))))))))))..))).)).((....((.....)).))........
>474113 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
AATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCGCGACCGTAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTA
((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.((.((((((...))).))))))))))).).)))...)))))))).......((((((...).))))).......
>117671327 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>117671328 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>117671329 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>164514095 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>164514096 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>164514097 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))..................
>257479970 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTCTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..).)..))).))))).))...(((...).))
>257479966 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCCGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..)..).))).))))).))...(((...).))
>162296310 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..)..).))).))))).))...(((...).))
>257479964 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..)..).))).))))).))...(((...).))
>257479968 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..)..).))).))))).))...(((...).))
>257479969 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 3 (see details)
TCAACTTACGAGCTTCTTGCGAGGTTTGTAGGGTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTAT
((((((((..((((((....))))))))..)).))))....(((((...((((((((....)))))))).)))))....((.(..(((.(.(((....(..(.((.(.....(((((((((...))).))))))......)))..)..).))).))))).))...(((...).))
>291359247 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 1 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTATAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTGATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATATCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCACTTGAGAGACAACTTTATGACCTCTGA
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...((.(((....(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))....)))...)))))))).......(((((......))))).................
>257479965 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 1 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTATAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTGATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATATCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCACTTGAGAGACAACTTTATGACCTCT
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...((.(((....(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))....)))...)))))))).......(((((......)))))...............
>257479967 see NCBI Nucleotide Ganoderma adspersum Method 1 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTATAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTGATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATATCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCACTTGAGAGACAACTTTATGACCTCT
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((...((.(((....(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))....)))...)))))))).......(((((......)))))...............
Select All

Show entries per page


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.