Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (177 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Ganoderma lucidum: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Polyporales; Ganodermataceae; Ganoderma; Ganoderma lucidum;
Select All
>5565679 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 1 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACAAACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTTGTGAGACAGCTTTATGACCTCTGA
........((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))..........((((((......(((....(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))....)))......)))))).......(((((......))))).................
>38455347 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGATTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAGACAGCTTTATGACCTCTGA
....((..((((((((((((.((.....)).))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((...)))).................
>474126 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
AATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTNGGCCGTTCTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATNGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCATCTCAGTTGGAGACAACTTTA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((.(((((....))))).)).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.((.((((((...))).))))).)))).))..)))...))))))))........((((.....))))........
>474130 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
AATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......(((((.....))))).......
>474132 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
AATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTNGGCCGTTNTNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((.((((.(...))))).)).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......(((((.....))))).......
>5764512 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
AATCTTCAACCTACGAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTNTACGCCGCGACCGTGAAGCGCTTTGGGCAAGCTTCTAACCGTGTCACTTGGAGATTGCTTTA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))....))))))))).......((.((.....)).)).......
>5764532 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
AATCTTCAACCTACGAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTNTACGCCGCGACCGTGAAGCGCTTTGGGCAAGCTTCTAACCGTGTCACTTGGAGATTGCTTTA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))....))))))))).......((.((.....)).)).......
>62275823 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 2 (see details)
ATGAAATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCSTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA
........(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...)..))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(..(.(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))))))).))..))).(((((((((.((....)).)))..)).)))).............
>90109959 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATYGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109962 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCRTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109960 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((((((((.....)))))))))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>90109958 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCYTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTSTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGAC
((...((((((((.(((((.....))))).)))).))))..))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)))))))).......((((....))))
>49357481 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
AATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGA
((..(((((((((((((((.....)))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...))))))))........(((.....)))
>90109961 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTACAAGCCTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((((....)).))))).(.((..(((((((...((((((.((..(.((.(....(((((..(((((.(((...)))..).)))...))))))).)).))))))))))).))))).)).)..((((((....))))))
>853941 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TGAAATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTATG
((((...)))).((((((((((.....))))))))))...(((((((((((((((((((.(((((.((((((((((.(.((.(..(.(...(.(((((((.....))))))))))).)).).))....).)).......))))))))..)).)))))))))))))))..))))..((.((.....)).))
>853935 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCNNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>853936 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCNNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>853939 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...).))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>853942 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTCTNGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTNAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...).))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>853940 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TGAAATCTTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTGTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAANGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTAT
((((...)))).((((((((((.....))))))))))...(((((((((((((((((((.(((((.((((((((((.(.((.(..(.(...(.(((((((.....))))))))))).)).).))....).)).......))))))))..)).)))))))))))))))..))))......(.((.....)).)
>853937 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTNTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...).))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>853938 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 3 (see details)
TTCAACCTGCAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTNTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCAGTGTGATAATGTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTNAGTTGGAGACAACTTTATGAC
(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...((((((((...).))))))).)))))........((((...(.((((.(((...((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)..)))...)).)).)..))))..((((.(((((....)))))..).)))
>49357482 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 1 (see details)
ATGAAATCTTCAACTTACAAACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTTGTGAGACAGCTTTATGACCTCTGA
........((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))..........((((((......(((....(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))....)))......)))))).......(((((......))))).................
>5764510 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 1 (see details)
AATCTTCAACCTACGAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCGTTCTTGGTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGCTTTGGGCRAGCTTCTAACCGTCTCACTTGGAGACAGCTTTA
....(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((..((((...(((...(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).....)))...)))).)))).......(((((.....))))).......
>5764531 see NCBI Nucleotide Ganoderma lucidum Method 1 (see details)
AATCTTCAACCTACGAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCGTTCTTGGTCAGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGCTTTGGGCRAGCTTCTAACCGTCTCACTTGGAGACAGCTTTA
....(((((((((((((((.....)))))))))).)))))...(((((...(((((((......))))))).)))))..........((((..((((...(((...(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).....)))...)))).)))).......(((((.....))))).......
Select All

Show entries per page      Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.