Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (1038 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Genisteae: root; cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; core eudicotyledons; rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; Genisteae;
Select All
>2230797 see NCBI Nucleotide Chamaecytisus purpureus Method 1 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCAGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGCGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((((((((.(((.....)))))))))....))))))))...((((((..(((.(((......))).)))..))))))..((.(((((..((((((.(((.((((((..((.((((...(((((....)))))..)))).)).)))).))..))))))))).......))))).))..(((..((((.((...)).))))......))).
>2230731 see NCBI Nucleotide Adenocarpus complicatus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGGCTCTGTGACCCATGGGGCCTGTTGGCCGCCTAAGACTGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..((.((((((((....)))).)).)....))).
>2230753 see NCBI Nucleotide Adenocarpus foliolosus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGGCTCTGTGACCCATGGGGCCTGTTGGCCGCCTAAGACTGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..((.((((((((....)))).)).)....))).
>2230759 see NCBI Nucleotide Adenocarpus telonensis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGGCTCTGTGACCCATGGGGCCTGTTGGCCGCCTAAGACTGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..((.((((((((....)))).)).)....))).
>2230763 see NCBI Nucleotide Adenocarpus viscosus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGGCTCTGTGACCCATGGGGCCTGTTGGCCGCCTAAGACTGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..((.((((((((....)))).)).)....))).
>2230765 see NCBI Nucleotide Argyrolobium zanonii Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGCGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....))))))))).)...))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..)))).....(.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).)...(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230775 see NCBI Nucleotide Cytisus arboreus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAATGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGTGGGGTGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCACTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((.(((((.(((.....)))))))).....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230789 see NCBI Nucleotide Cytisus multiflorus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAATGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((.(((((.(((.....)))))))).....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230791 see NCBI Nucleotide Cytisus nigricans Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCCTGCTGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))....)))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..((((((.((.((...)).)).).).)..))).
>2230795 see NCBI Nucleotide Chamaecytisus prolifer Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCATGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((((((((.(((.....)))))))))....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230799 see NCBI Nucleotide Genista sagittalis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCATGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGATCAGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGAATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGGTCGTGCGTGTCACCCCCACTAGCTTTGTGACTCTGTGACCCATGTGGTCTGTTGGCTGCCTAAGACGGGA
.....((((((.(((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((((((.(...))))))))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..(((.(((((((....))))).).)....))).
>2230801 see NCBI Nucleotide Cytisus scoparius Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAATGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((.(((((.(((.....)))))))).....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230803 see NCBI Nucleotide Cytisophyllum sessilifolium Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGCGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGATGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....(((((((.(.((((.(((.....))))))).).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((...(((((....)))))..)))))))))).))))..)).))))).).)..).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230807 see NCBI Nucleotide Chamaecytisus supinus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTATGACGGGA
.....((((((((((((((.(((.....)))))))))....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((((((((((....)))).)).))...))).
>2230809 see NCBI Nucleotide Genista tridentata Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAATCTCGAGACCTATCGTGTGTGTCACTTCCACCAGCTTTGTGACTCTGTGACCCATGGGGCCTGTTGGCCGCCTATGACGGGA
.....(((((((.((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.((((((((((((((((((((((((((..(.(((..((((((...).)))).))))))))))).))))..)))))))).))...).))))).))..(((((((((((....)))).)).))...))).
>2230815 see NCBI Nucleotide Calicotome villosa Method 2 (see details)
AATCGTTGCCCCAATGCCTTGGCCACGTGCTAGACATTGAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGTATCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCTGTGGTGGAGGTCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTGACCCCCACCAGATTTGTGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....(((((((((((.((.(((.....))))).)))....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).)))).))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230817 see NCBI Nucleotide Cytisus villosus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCATCGACTGGGGTGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCATGGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGATTTGTGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((((((((.(((.....)))))))))....))))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230836 see NCBI Nucleotide Erinacea anthyllis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTTGCCACGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGTGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCAAGGGGTCTGTTGGCCTCCTAAGACGGGA
(((..((((((((((((((..((.....)).)))))).)...))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).))..(((.(((((((....)))).))).....))).
>2230838 see NCBI Nucleotide Genista aetnensis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTTCCTTGGCCATGTTCTAGGCACCAAGTGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGTGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((((.(((.((..(...)))))).)).)...)))))))...((((((..(((((((.(...))))))))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))).)..))))).))...).))))).))..(((.(((((((....))))))..)....))).
>2230842 see NCBI Nucleotide Genista cinerea Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGACCACGTGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAAAGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTTGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCCCCTCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGACCACCTAAGACGGGA
.....(((.((((((((((.(.(.....).))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((.((((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)))).))).))...).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230844 see NCBI Nucleotide Genista elata Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCTTGCGCCTTGGCCTTGTGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAACGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGATGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACTAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGTGGTCTGTTGGCCACCTATGACGGGA
.....(((((((((.((((.(((.....))))))).).)...)))))))...((((((..(((((((.(...))))))))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((...((((.(...)))))..)))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..(((((((((((....))))).).))...))).
>2230846 see NCBI Nucleotide Genista florida Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACCGTGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCATGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....))))))))).)...))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....((.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230848 see NCBI Nucleotide Genista germanica Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTCCTAGGCATTAAGTGGGGTGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCATTGTCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATTGATGGTGGCTGAGTTAAGTCTCGAGACCGATCGTGTGTGTCACCCCCACCAGCTTTGTGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
.....((((((((((((((.(((...)..)))))))).)...)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((...).)))).))))))))))).))))..)).))))).))...).))))).))..(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230850 see NCBI Nucleotide Genista januensis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCATGTGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAGTGTTGGCTTCCCGTGAGCAGCGTCTCACGGTTGGTTGAAATCTGAGTCTGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACTAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCGCCTAAGACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....))))))))).)...))))))))))..((((..(((((((.(...))))))))..)))).....(.(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).))))).)...(((.(((((((....)))).)).)....))).
>2230855 see NCBI Nucleotide Genista tinctoria Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCTTGCGCCTTGGCCTTGTGCAAGGCACTGAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAACGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCACCGTGATGGATGGTGGATGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACTAGCTTTGCGACTCTGTGACCCATGTGGTCTGTTGGCCACCTATGACGGGA
.....(((((((((.(((((.((.....))))))).).)...)))))))...((((((..(((((((.(...))))))))..))))))..((.(((((((((((((.((((((((((((...((((...((((.(...)))))..)))))))))).)))...)))))))).))...).))))).))..(((((((((((....))))))..))...))).
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.